DPAGT1靶点赋能包数据集

该数据集来自 zenodo.org,聚焦 ER 整合膜酶 DPAGT1 的靶点赋能包。DPAGT1 催化寡糖-P-P-多萜醇合成第一步,其突变导致肢带型先天性肌无力综合征和先天性糖基化障碍 1j 型,过表达还与口腔癌相关

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2024-08-02 更新
浏览 7
基因组proteintarget enabling packagestructurediseasecanceroncologyneuropsychiatryneuroneurological genetic disordersmetabolic diseasesinfectious diseasemalaria
Data from: Dolichyl-Phosphate Alpha-N-Acetyl glucosaminyl transferase (DPAGT1); A Target Enabling Package

基本信息

模态
基因组
大小
0.001157213 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2024-08-02
版本
v1

资源简介

DPAGT1靶点赋能包数据集

Dolichyl-Phosphate Alpha-N-Acetyl glucosaminyl transferase (DPAGT1); A Target Enabling Package

该数据集来自 zenodo.org,聚焦 ER 整合膜酶 DPAGT1 的靶点赋能包。DPAGT1 催化寡糖-P-P-多萜醇合成第一步,其突变导致肢带型先天性肌无力综合征和先天性糖基化障碍 1j 型,过表达还与口腔癌相关。数据包含该酶及 V264G 突变体结构、与 50 nM 抑制剂 tunicamycin 的复合物结构,以及酶活性和热稳定性检测方法,可用于评估 DPAGT1 突变体活性与稳定性及小分子效应(来源 Zenodo,cc-by-4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:A UK Hub to Catalyse Open Target Discovery.。源站首次发布:2017-06-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):内质网整合膜酶多萜醇磷酸α-N-乙酰葡糖胺磷酸转移酶(DPAGT1)催化寡糖-P-P-多萜醇单元合成的第一步,该单元为蛋白质N-糖基化提供聚糖结构。DPAGT1突变导致两种肌肉无力病症:肢带型先天性肌无力综合征(CMS)和先天性糖基化障碍1j型(CDG1j)。DPAGT1过表达还与口腔癌相关。我们已生产并解析了该整合膜酶DPAGT1的结构,包括来自CMS患者的V264G突变体,以及与50 nM抑制剂tunicamycin的复合物。我们开发了酶活性和热稳定性检测方法,使我们能够评估DPAGT1突变体的活性和稳定性以及小分子的效应。有超过20个DPAGT1相关错义变异

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 1.16 MB。数据集 DOI:10.5287/bodleian:y0r1MKpmx。

【主题与分类】

主题标签:protein、target enabling package、structure、disease、cancer、oncology、neuropsychiatry、neuro、neurological genetic disorders、metabolic diseases。本站分类:神经系统疾病/重症肌无力。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/1209151

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-08-02,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

curl -L -o "DPAGT1_TEP_datasheet_v1.pdf" "https://zenodo.org/api/records/1209151/files/DPAGT1_TEP_datasheet_v1.pdf/content"

文件清单

  • DPAGT1_TEP_datasheet_v1.pdf(1.1 MB)

数据集大小约 1.2 MB。

数据说明

内质网整合膜酶多萜醇磷酸α-N-乙酰葡糖胺磷酸转移酶(DPAGT1)催化寡糖-P-P-多萜醇单元合成的第一步,该单元为蛋白质的N-糖基化提供聚糖结构。DPAGT1的突变会导致两种肌肉无力病症:肢带型先天性肌无力综合征(CMS)和先天性糖基化障碍1j型(CDG1j)。DPAGT1的过表达还与口腔癌相关。我们已制备并解析了这种整合膜酶DPAGT1的结构,包括来自一名CMS患者的V264G突变体结构,以及其与50 nM抑制剂衣霉素的复合物结构。我们开发了酶活性和热稳定性检测方法,从而能够评估DPAGT1突变体的活性与稳定性以及小分子的影响。在CMS和CDG1j患者中存在超过20种DPAGT1相关错义变异。我们已将这些突变映射到结构上,并将利用本文所述的检测方法来评估这些错义变异如何影响DPAGT1的活性和稳定性。

许可

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