IDR idr0086-miron-micrographs 实验D 显微图像数据集

主题标签:神经系统疾病、多发性硬化、显微图像、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:神经系统疾病/多发性硬化

idr
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医学影像图像分割神经系统疾病多发性硬化显微图像细胞成像组织成像IDROMEEMBL-EBI
IDR idr0086-miron-micrographs (experimentD)

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

IDR idr0086-miron-micrographs 实验D 显微图像数据集

IDR idr0086-miron-micrographs (experimentD) 是 Image Data Resource(IDR)中收录的一项细胞与组织显微成像研究,属于神经系统疾病领域中与多发性硬化相关的影像数据集。该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,是 IDR 平台经过策展的成像研究之一,遵循 OME 与 EMBL-EBI 相关规范。就规模而言,该实验包含 2 幅图像,整体体量较小,适合作为特定实验条件下的示例性显微影像资源使用。数据集的主题标签涵盖神经系统疾病、多发性硬化、显微图像、细胞成像、组织成像等方向,本站将其归类于神经系统疾病 / 多发性硬化。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集隶属于 IDR 平台上的研究 idr0086-miron-micrographs,对应其中的 experimentD 实验。IDR(Image Data Resource)是一个经过策展的细胞与组织成像研究资源库,由 OME 与 EMBL-EBI 相关体系支持。该研究被归入神经系统疾病范畴,并与多发性硬化这一具体疾病方向相关联,说明其影像内容服务于神经组织或相关细胞层面的观察需求。多发性硬化是一种累及中枢神经系统的疾病,相关成像研究通常关注组织与细胞层面的形态学表现,本数据集即处于这一研究语境之中。

【数据内容】

该实验包含 2 幅图像,内容形式为显微图像,涉及细胞成像与组织成像两类主题标签。图像以 OME 相关规范组织,属于经策展的成像研究数据。除上述信息外,关于图像的具体尺寸、通道数、像素分辨率、染色方式、视野数量、时间序列等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集的来源站为 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource 平台。该研究在 IDR 中的标识为 idr0086-miron-micrographs,实验标识为 experimentD。IDR 作为策展型资源,其收录的研究通常经过整理与规范化描述,并遵循 OME 与 EMBL-EBI 的相关标准。关于样本制备、成像仪器、成像参数、采集时间与地点等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与分类,该数据集可应用于神经系统疾病、特别是多发性硬化相关的显微影像观察与研究场景,也可用于细胞成像与组织成像方向的教学、方法演示或影像浏览。由于其属于 IDR 策展资源并遵循 OME 规范,亦可作为了解该平台数据组织方式的示例。关于该数据集在具体研究中的验证性用途或结论性应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 idr.openmicroscopy.org 访问,检索标识为 idr0086-miron-micrographs,实验为 experimentD。使用者可依据 IDR 平台提供的浏览与检索方式查看这 2 幅显微图像。关于下载格式、API 调用方式、本地加载流程等具体操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 平台上的策展成像研究,遵循 OME 与 EMBL-EBI 相关规范。其规模较小,仅包含 2 幅图像,因此在统计代表性或覆盖广度方面存在天然限制。关于图像质量评估、元数据完整度、是否存在缺失或偏差等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,属于 IDR 策展资源,与 OME、EMBL-EBI 相关体系关联。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制与署名要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-1161

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0086-miron-micrographs. Experiment: experimentD. Images: 2. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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