IDR idr0086-miron-micrographs 实验A 显微图像数据集

主题标签:神经系统疾病、多发性硬化、显微图像、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:神经系统疾病/多发性硬化

idr
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医学影像图像分割神经系统疾病多发性硬化显微图像细胞成像组织成像IDROMEEMBL-EBI
IDR idr0086-miron-micrographs (experimentA)

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

IDR idr0086-miron-micrographs 实验A 显微图像数据集

IDR idr0086-miron-micrographs (experimentA) 是一个聚焦神经系统疾病、特别是多发性硬化的显微成像数据集,收录于 Image Data Resource(IDR)平台。该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,属于经过策展的细胞与组织成像研究,遵循 OME 与 EMBL-EBI 相关规范。数据集包含 25 幅图像,以实验 experimentA 的形式组织,主题涵盖显微图像、细胞成像与组织成像。本站将其归类于神经系统疾病 / 多发性硬化方向,适合用于观察与该疾病相关的细胞和组织形态学特征。整体而言,该数据集规模精简、来源明确,可作为神经免疫与脱髓鞘疾病影像研究的参考资源。

【数据集背景】

多发性硬化是一种累及中枢神经系统的疾病,其病理过程涉及免疫介导的脱髓鞘与神经损伤。围绕该疾病的研究常依赖显微成像手段,在细胞与组织层面观察病变特征。IDR idr0086-miron-micrographs 正是面向这一方向建立的成像研究数据集,其英文全称为 IDR idr0086-miron-micrographs (experimentA),归属于神经系统疾病 / 多发性硬化分类。该数据集托管于 Image Data Resource,这是一个面向细胞与组织成像研究的策展型资源平台,与 OME、EMBL-EBI 的标准化体系相关联,为图像的存储、组织与再利用提供基础。

【数据内容】

该数据集的核心内容是显微图像,共包含 25 幅图像,以 experimentA 作为实验标识进行组织。图像类型覆盖细胞成像与组织成像两个层面,主题标签包括神经系统疾病、多发性硬化、显微图像、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。这些图像以 OME 相关格式规范进行描述与组织,便于在支持该标准的软件环境中读取与浏览。除上述信息外,源站未提供关于图像具体分辨率、通道数量、染色方法、样本类型细分或时间序列等更详细的字段说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource 平台。源站将其描述为 IDR study idr0086-miron-micrographs,实验部分为 experimentA,图像数量为 25,并注明其为 Image Data Resource 中经过策展的细胞 / 组织成像研究,遵循 OME 与 EMBL-EBI 相关体系。关于具体的成像仪器、采集参数、样本制备流程、实验地点与时间等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其神经系统疾病 / 多发性硬化的分类以及细胞与组织成像的主题,该数据集可用于与该疾病相关的显微形态观察、图像分析流程的测试与演示,以及细胞和组织成像方法的教学与参考。由于图像以 OME 相关规范组织,也适合用于验证支持该标准的图像读取、可视化与元数据处理工具。关于该数据集是否适用于特定的临床诊断、药物筛选或定量分析任务,源站未提供相应说明。

【使用方法】

该数据集可通过 Image Data Resource 平台访问,其来源站为 idr.openmicroscopy.org。使用者可借助支持 OME 数据模型的图像查看与分析软件打开和浏览这些显微图像。由于数据集以 study 与 experiment 的形式组织,检索时可依据 idr0086-miron-micrographs 及 experimentA 进行定位。关于具体的下载方式、访问权限、API 接口或配套分析脚本,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 Image Data Resource 中经过策展的成像研究,来源明确,遵循 OME 与 EMBL-EBI 相关规范,具备较好的可追溯性与标准化基础。其规模为 25 幅图像,属于相对精简的数据集。关于图像的分辨率、信噪比、标注完整性、批次效应或潜在偏倚等质量维度,源站未提供。使用者在使用前应结合自身研究目的评估其适用性。

【引用与许可】

该数据集托管于 Image Data Resource,来源站为 idr.openmicroscopy.org,与 OME、EMBL-EBI 体系相关。关于具体的引用格式、文献出处、许可条款或使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应查阅来源站的相关说明以确认合规要求。

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源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-1158

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0086-miron-micrographs. Experiment: experimentA. Images: 25. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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