吉兰-巴雷综合征相关基因网络与通路数据集
主题标签:吉兰-巴雷综合征、基因网络、通路分析、神经系统疾病、转录组。本站分类:神经系统疾病/吉兰-巴雷综合征。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖吉兰-巴雷综合征。

基本信息
资源简介
吉兰-巴雷综合征相关基因网络与通路数据集
Data from: Identification of Gene Networks and Pathways Associated with Guillain-Barre Syndrome 是一个面向神经系统疾病研究的公开转录组数据集,聚焦于吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barré Syndrome)相关基因网络与通路的识别。该数据集由 Kuo-Hsuan Chang、Chiung-Mei Chen 等研究者于 2011 年发布,收录于 EBI ArrayExpress 数据库,实验编号为 E-GEOD-31014。数据集主题涵盖吉兰-巴雷综合征、基因网络、通路分析、神经系统疾病与转录组等方向,在本站归入神经系统疾病/吉兰-巴雷综合征分类。整体而言,该数据集为研究吉兰-巴雷综合征的分子机制、基因表达变化及其涉及的生物学通路提供了可公开获取的数据基础,适合用于转录组层面的基因网络分析与通路富集研究。
【数据集背景】
吉兰-巴雷综合征是一种累及周围神经系统的自身免疫性神经疾病,其发病机制涉及免疫介导的神经损伤,在分子层面常表现为基因表达谱的改变以及多条生物学通路的协同参与。识别与该疾病相关的基因网络和信号通路,有助于理解疾病的发生发展过程并探索潜在的生物标志物。该数据集正是围绕这一研究目标产生,其英文名称明确指向“与吉兰-巴雷综合征相关的基因网络与通路的识别”,属于神经系统疾病领域中以转录组数据为切入点的研究资源。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括吉兰-巴雷综合征、基因网络、通路分析、神经系统疾病和转录组,表明其内容围绕基因表达层面的数据展开,并服务于基因网络构建与通路分析。数据集在本站被归类为神经系统疾病/吉兰-巴雷综合征,属于该疾病方向的公开数据集。关于样本数量、分组设计、检测平台、基因数量等具体数据规模与组成信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体收录于 EBI ArrayExpress 数据库,实验编号为 E-GEOD-31014。源站描述中列出的研究者为 Kuo Hsuan Chang、Kuo-Hsuan Chang 与 Chiung-Mei Chen,发布年份为 2011 年。数据集的正式引用形式为“Identification of Gene Networks and Pathways Associated with Guillain-Barre Syndrome [Dataset]”,并附有对应的 ArrayExpress 实验链接。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批及具体的实验操作流程,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题定位,该数据集适用于吉兰-巴雷综合征相关的转录组研究,例如基因表达差异分析、基因共表达网络构建、通路富集与功能注释分析,以及与其他神经系统疾病数据集的比较研究。它也可用于方法学验证,如基因网络识别算法与通路分析流程的测试。此外,该数据集可作为神经系统疾病领域公开数据资源,支持科研人员开展二次分析与结果复现。关于该数据集在具体研究中的实际应用案例与验证结论,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 EBI ArrayExpress 平台以实验编号 E-GEOD-31014 公开提供,使用者可依据该编号在 ArrayExpress 中检索并获取数据。使用时通常需要结合转录组数据分析工具完成预处理、差异表达分析与通路分析等步骤。关于数据文件的具体格式、下载方式、预处理要求及配套分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由 EBI ArrayExpress 收录,具备公开数据库的收录与引用信息,并附有明确的研究者署名与发布年份。其主题集中于吉兰-巴雷综合征的基因网络与通路分析,适用范围相对专一。关于数据集的样本量、数据完整性、批次效应、质控指标及已知技术局限,源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时,应使用源站给出的引用信息:Kuo Hsuan Chang、Kuo-Hsuan Chang、Chiung-Mei Chen(2011),Identification of Gene Networks and Pathways Associated with Guillain-Barre Syndrome [Dataset],EBI ArrayExpress,实验编号 E-GEOD-31014。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-31014
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Kuo Hsuan Chang; Kuo-Hsuan Chang; Chiung-Mei Chen (2011). Identification of Gene Networks and Pathways Associated with Guillain-Barre Syndrome [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-31014
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