RNA编辑与额颞叶痴呆
该数据集包含与额颞叶痴呆相关的RNA编辑事件数据,涵盖编辑位点位置、编辑类型、编辑频率等基因模态信息,并整合疾病本体描述,主要用于研究RNA编辑在神经退行性疾病中的分子机制、探索潜在生物标志物以及支持额颞叶痴呆的病理学分析。

基本信息
资源简介
RNA编辑与额颞叶痴呆
【数据集背景】
源站首次发布:2018-09-02。
【数据内容】
源站原始描述:RNA编辑作为一种重要的转录后RNA修饰类型,在许多生物学过程中起着关键作用,涉及多种人类疾病。我们提供与Frontotemporal Lobar Dementia相关的编辑事件以及包含疾病ontology在内的描述信息,对每一个异常RNA编辑事件,提供编辑位点位置、编辑类型、编辑频率等信息。
【主题与分类】
主题标签:RNA编辑、疾病、关联、额颞叶痴呆、生物学、表观组。
【获取与许可】
源站页面:https://bigd.big.ac.cn/edk/disease/Frontotemporal%20Lobar%20Dementia
使用许可:完全共享。
规范引用:CSTR:15937.11.edk58
【使用注意】
· 源站最后修改于 2021-05-11,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于RNA编辑事件与额颞叶痴呆(Frontotemporal Lobar Dementia)的关联研究。数据集提供了与额颞叶痴呆相关的异常RNA编辑事件信息,包括编辑位点位置、编辑类型、编辑频率等关键数据,并整合了疾病本体(ontology)描述信息。数据来源于国家基因组科学数据中心,通过生物信息学分析构建,旨在支持RNA编辑在神经退行性疾病中的机制探索、生物标志物发现及相关病理研究。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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