谷氨酸转运体同源物GltTk突变揭示发作性共济失调6病理机制

主题标签:神经系统疾病、共济失调、GltTk、突变、MD模拟、发作性共济失调6。本站分类:神经系统疾病/共济失调。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,由Zenodo提供,主题涵盖神经系统疾病。

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时间序列预测神经系统疾病共济失调GltTk突变MD模拟发作性共济失调6
Mutation in glutamate transporter homologue GltTk provides insights into pathologic mechanism of episodic ataxia 6

基本信息

模态
时间序列
大小
0.04666784 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

谷氨酸转运体同源物GltTk突变揭示发作性共济失调6病理机制

本数据集围绕谷氨酸转运蛋白同源物 GltTk 的突变展开,旨在为发作性共济失调 6 型的病理机制研究提供分子动力学模拟层面的可复现数据支撑。数据集英文名称为“Mutation in glutamate transporter homologue GltTk provides insights into pathologic mechanism of episodic ataxia 6”,由 Colucci, E.、Anshari, Zaid R.、M.F. Patino-Ruiz、Nemchinova, M.、J. Whittaker、Slotboom, D.J.、Guskov, A. 等作者共同完成,通过 Zenodo 平台于 2022 年发布,采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可协议。该数据集归属于神经系统疾病 / 共济失调分类,主题标签涵盖神经系统疾病、共济失调、GltTk、突变、MD 模拟以及发作性共济失调 6,面向该领域的研究人员公开。

【数据集背景】

发作性共济失调 6 型是一种与谷氨酸转运蛋白功能异常相关的神经系统疾病。谷氨酸转运蛋白负责清除突触间隙中的谷氨酸,其功能失调会导致神经信号传递异常,进而引发共济失调等临床表现。GltTk 作为谷氨酸转运蛋白的同源物,是研究该类蛋白结构与功能关系的重要模型。本数据集正是围绕 GltTk 中的突变展开,旨在通过分子动力学模拟揭示该突变导致发作性共济失调 6 型的病理机制,为理解疾病发生发展提供计算层面的证据。

【数据内容】

本数据集的核心内容是用于复现相关分子动力学模拟的数据。源站描述指出,该数据集用于复现论文“New insights into a mutation leading to episodic ataxia 6”中所描述的 MD 模拟。数据集主题标签包括神经系统疾病、共济失调、GltTk、突变、MD 模拟、发作性共济失调 6,表明其内容涉及 GltTk 突变体的模拟轨迹及相关参数。关于模拟的具体体系组成、模拟时长、力场参数、轨迹文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集由 Zenodo 提供,来源站为 doi.org,发布时间为 2022 年。作者包括 Colucci, E.、Anshari, Zaid R.、M.F. Patino-Ruiz、Nemchinova, M.、J. Whittaker、Slotboom, D.J.、Guskov, A.。数据集的机构归属为 Zenodo。关于原始实验条件、模拟软件、计算平台等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病领域,尤其是共济失调相关研究。具体而言,可用于复现和验证 GltTk 突变体的分子动力学模拟,帮助研究人员从原子层面理解突变如何影响转运蛋白的结构与动力学行为,进而关联到发作性共济失调 6 型的病理机制。此外,也可作为方法学参考,用于类似膜蛋白突变体的 MD 模拟研究。关于是否适用于药物筛选、临床诊断或其他具体应用,源站未提供。

【使用方法】

本数据集为公开数据集,采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可,使用者可自由共享和改编,但需注明出处。使用时应结合源站描述,复现论文中所述的 MD 模拟流程。关于具体的文件结构、软件版本、运行命令等操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

数据集由 Zenodo 发布,采用开放许可,具备可获取性和可复用性。作者团队包含多位研究人员,来源站为 doi.org,具有一定的可信度。然而,关于数据的具体质量指标、模拟收敛性、重复次数、验证方法等,源站未提供。此外,数据集仅针对 GltTk 同源物,其结论向人类谷氨酸转运蛋白的直接外推需谨慎。关于数据集的局限性,源站未提供更多说明。

【引用与许可】

使用本数据集时,应按照 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可协议进行引用和署名。引用信息应包括数据集英文名称、作者、发布平台 Zenodo、发布时间 2022 年以及来源站 doi.org。关于具体的引用格式或 DOI 编号,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.6811054

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 46.7 MB。

数据说明

Dataset to reproduce MD simulations described in “New insights into a mutation leading to episodic ataxia 6”

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