弗里德赖希共济失调成纤维细胞基因表达模式的RNA测序综合分析揭示蛋白质合成因子和溶质载体水平改变
该数据集来自 EBI 的 Expression Atlas（差异表达实验），物种为 Homo sapiens，聚焦 Friedreich 共济失调患者成纤维细胞的基因表达模式
基本信息
资源简介
弗里德赖希共济失调成纤维细胞基因表达模式的RNA测序综合分析揭示蛋白质合成因子和溶质载体水平改变
E-GEOD-104288 是一个来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集，物种为 Homo sapiens，聚焦 Friedreich 共济失调患者成纤维细胞中的基因表达模式。该数据集的全称为“Comprehensive Analysis of Gene Expression Patterns in Friedreich’s Ataxia Fibroblasts by RNA Sequencing Reveals Altered Levels of Protein Synthesis Factors and Solute Carriers”，通过 RNA 测序手段对相关样本进行转录组层面的比较分析，旨在揭示疾病状态下基因表达水平的改变。数据集在本站归类于神经系统疾病 / 共济失调方向，主题标签为 Differential，适合关注共济失调分子机制、成纤维细胞模型以及差异表达分析的研究人员参考使用。
【数据集背景】
Friedreich 共济失调是一种神经系统疾病，属于共济失调类疾病范畴。该数据集围绕这一疾病背景，以患者来源的成纤维细胞为研究对象，利用 RNA 测序技术开展基因表达模式的综合分析。其英文标题明确指出，该研究通过 RNA 测序揭示蛋白质合成因子和溶质载体水平的变化，说明该数据集关注的核心方向是疾病相关细胞中基因表达调控异常，尤其是与蛋白质合成和物质转运相关的基因类别。数据集来源于 EBI 的 Expression Atlas，属于差异表达实验类型，因此其设计目的并非单纯展示基因表达谱，而是通过比较分析识别在不同条件下表达水平发生显著变化的基因。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Differential，表明其内容围绕差异表达结果展开。源站描述将其界定为 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens。数据集标题中提及“Comprehensive Analysis of Gene Expression Patterns”，说明其覆盖范围是对基因表达模式的系统性分析；同时标题指出“Altered Levels of Protein Synthesis Factors and Solute Carriers”，提示分析结果涉及蛋白质合成因子和溶质载体两类基因的表达水平改变。除上述信息外，关于具体样本数量、分组方式、检测基因数目、差异表达基因列表、统计阈值等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 ebi.ac.uk，即 EBI 的 Expression Atlas 平台。源站将其描述为 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens。数据集英文名中包含 E-GEOD-104288 这一标识，表明其与 GEO 体系存在关联，但源站未提供更详细的采集流程、实验平台、建库方法、测序深度或样本处理信息。该数据集在本站被归类为神经系统疾病 / 共济失调，主题标签为 Differential。除来源站和分类信息外，关于样本采集地点、时间、伦理审批及具体实验操作步骤，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与 Friedreich 共济失调相关的转录组差异表达分析场景。研究人员可将其用于探讨患者成纤维细胞中基因表达模式的变化，尤其是蛋白质合成因子和溶质载体相关基因的表达改变。由于数据集属于差异表达实验，也可用于比较不同条件下基因表达水平的差异，或作为共济失调分子机制研究的参考数据。此外，该数据集可服务于神经系统疾病分类下的生物信息学分析、候选基因筛选和表达调控研究等场景。关于具体分析流程、推荐工具或验证实验设计，源站未提供。
【使用方法】
该数据集来源于 EBI Expression Atlas，用户可通过该平台访问相关实验信息。数据集标识为 E-GEOD-104288，主题标签为 Differential，物种为 Homo sapiens。使用者可根据 Expression Atlas 的常规访问方式获取差异表达结果，并结合自身研究目的进行解读。关于数据下载格式、文件结构、分析参数、可视化方式及二次分析建议，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 EBI Expression Atlas，属于差异表达实验，物种为 Homo sapiens，聚焦 Friedreich 共济失调患者成纤维细胞的基因表达模式。其标题表明分析涉及蛋白质合成因子和溶质载体水平的变化。然而，关于样本量、生物学重复、统计显著性阈值、多重检验校正方法、测序质量指标及潜在批次效应等信息，源站未提供。因此，在使用该数据集时，应结合源站提供的原始描述和实验设计信息进行评估。该数据集基于成纤维细胞模型，是否可直接推广至其他细胞类型或临床表型，源站未提供相关说明。
【引用与许可】
该数据集英文名为 E-GEOD-104288: Comprehensive Analysis of Gene Expression Patterns in Friedreich’s Ataxia Fibroblasts by RNA Sequencing Reveals Altered Levels of Protein Synthesis Factors and Solute Carriers，来源站为 ebi.ac.uk，本站分类为神经系统疾病 / 共济失调，主题标签为 Differential。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制及版权声明，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-104288
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas实验（差异表达）。物种：Homo sapiens。通过RNA测序对Friedreich共济失调成纤维细胞中的基因表达模式进行全面分析，揭示了蛋白质合成因子和溶质载体水平的改变。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
