Friedreich共济失调外周血生物标志物数据集

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,聚焦 Friedreich 共济失调患者外周血中的生物标志物

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浏览 2
基因组分类Differential
E-GEOD-102008: Peripheral blood biomarkers in Friedreich's ataxia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

Friedreich共济失调外周血生物标志物数据集

E-GEOD-102008 是一个以 Friedreich 共济失调为研究对象的基因表达数据集,英文全称为 Peripheral blood biomarkers in Friedreich's ataxia。该数据集收录于 EBI Expression Atlas,属于差异表达实验,物种为 Homo sapiens,研究材料为外周血。数据集聚焦于从 Friedreich 共济失调患者外周血中寻找可用的生物标志物,在本站归入神经系统疾病 / 共济失调分类。整体而言,它为研究这一遗传性神经退行性疾病的血液层面分子改变提供了公开可查的表达数据资源,适合关注共济失调机制、外周血标志物筛选及转录组差异分析的研究者参考使用。

【数据集背景】

Friedreich 共济失调是一种累及神经系统的疾病,在本站分类体系中归属于神经系统疾病下的共济失调类别。该数据集以患者外周血为切入点,围绕生物标志物展开研究,其主题标签为 Differential,表明其核心设计是比较不同条件之间的基因表达差异。数据集来源于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验集合,该平台通常汇集经过统一处理的表达实验,便于跨研究检索与比较。源站对该实验的描述明确指出其物种为人,研究主题为 Friedreich 共济失调外周血生物标志物。

【数据内容】

该数据集属于差异表达实验类型,即通过比较样本组之间的表达水平来识别显著变化的基因或转录本。研究对象为人类外周血,因而数据反映的是血液样本中的表达信息,而非中枢神经系统组织。主题标签 Differential 进一步说明其内容组织围绕差异比较结果展开。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、分组设计、检测平台、基因数量及具体差异基因列表等细节。

【采集与来源】

数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所维护的 Expression Atlas 资源。源站描述标明物种为 Homo sapiens,实验类型为 Differential,研究主题为 Friedreich 共济失调外周血生物标志物。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于探索 Friedreich 共济失调在外周血中的表达差异,支持生物标志物候选基因的检索与验证性分析;也可作为差异表达分析的参考数据,用于与其它共济失调或神经系统疾病表达研究进行比较。由于数据来自外周血,适合关注可及性样本标志物的转化研究方向。关于具体适用疾病亚型、人群特征或临床分层,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 EBI Expression Atlas 平台检索该实验编号 E-GEOD-102008,查看其差异表达结果。由于源站未提供下载格式、分析流程、标准化方法及配套代码等细节,具体使用方式需以平台页面说明为准。

【质量与限制】

该数据集为公开表达资源,其质量评估依赖源站的处理流程。源站未提供样本量、重复数、统计阈值、批次信息及验证实验结果,因此无法据此判断结果的稳健性与可推广性。使用时应结合原始平台文档确认分析细节。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-102008

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Peripheral blood biomarkers in Friedreich’s ataxia

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