sTREM2柔性柄结构域调控其与脑源性磷脂的相互作用

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A8c84fea921f280d7cf485463ac30ec406c8e7d904a4a8f24006cf6ecc68dfd36

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

小胶质细胞表面蛋白髓样细胞触发受体2（TREM2）在阿尔茨海默病（AD）中扮演着调节脑内稳态和炎症反应的关键角色。TREM2的可溶形式（sTREM2）在AD中展现出神经保护作用，但其潜在机制仍不明确。此外，TREM2与sTREM2在配体结合上的差异，对其在AD病理中的作用具有重要意义，但仍未得到解释。为填补这些知识空白，我们进行了迄今为止计算强度最大的关于人类(s)TREM2的分子动力学模拟，探索其与关键的损伤相关和脂蛋白相关磷脂的相互作用，以及AD风险突变R47H的影响。

我们的研究结果表明，sTREM2的柔性茎结构域通过调节Ig样结构域的动力学并改变其可及性，为sTREM2与TREM2之间差异性配体结合提供了分子基础，从而促进了这一过程。…，# sTREM2的柔性茎结构域调节其与脑源性磷脂的相互作用 数据集DOI：10.5061/dryad.0000000gn ## 数据和文件结构描述 与相关eLife论文中所述的MD轨迹、结构文件和分析文件（RMSD、RMSF）。https://doi.org/10.7554/eLife.102269.2 ### 文件和变量 #### 文件：eLife_Data_Availability.zip 描述： 此目录包含与相关eLife论文中所述模拟相对应的分子动力学（MD）轨迹、结构文件和分析输出（RMSD和RMSF）。 文件夹结构 顶层目录包含两个主要文件夹： * WT/ — 野生型（s）TREM2模拟 * R47H/ — R47H突变型（s）TREM2模拟 在每个文件夹内，子目录按模拟系统进行组织。

例如：* PSIG/ —— 在存在…的情况下对TREM2的Ig样结构域进行的模拟

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。