阿尔茨海默病Tau配对螺旋丝与D型肽D-TLKIVWR孵育数据集
4096 0.94 短肽如何解聚阿尔茨海默病中的 tau 纤维。主题标签:阿尔茨海默病、Tau蛋白、配对螺旋丝、D型肽、冷冻电镜、神经系统疾病

基本信息
资源简介
阿尔茨海默病Tau配对螺旋丝与D型肽D-TLKIVWR孵育数据集
Tau Paired Helical Filament from Alzheimer's Disease incubated with D-peptide D-TLKIVWR 是一个来源于电子显微镜公共图像存档库(EMPIAR)的冷冻电镜图像数据集,编号为 EMPIAR-13490。该数据集记录了经 D 型短肽 D-TLKIVWR 孵育处理后的阿尔茨海默病来源 Tau 蛋白配对螺旋丝样品,共包含 725.5 张显微图像。其研究指向为短肽如何解聚阿尔茨海默病中的 tau 纤维,属于神经系统疾病与阿尔茨海默病研究领域。数据集以多帧 EER 格式存储,每部电影包含 1683 个原始帧,采用无符号字节编码,总剂量为 50 e-/Ų,像素尺寸为 0.94 Å,图像宽度为 4096 像素。
【数据集背景】
该数据集聚焦于阿尔茨海默病相关的 Tau 蛋白病理结构。在阿尔茨海默病中,Tau 蛋白会异常聚集形成配对螺旋丝(Paired Helical Filament),这是该疾病典型的神经病理特征之一。本数据集所涉及的样品为来自阿尔茨海默病的 Tau 配对螺旋丝,并经过 D 型肽 D-TLKIVWR 孵育处理。相关研究主题为短肽如何解聚阿尔茨海默病中的 tau 纤维,属于神经系统疾病与阿尔茨海默病研究范畴。数据集来源站为 ebi.ac.uk,本站分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。
【数据内容】
数据集共包含 725.5 张显微图像,以多帧 EER 格式记录。每部电影包含 1683 个原始帧,采用无符号字节(UNSIGNED BYTE)EER 格式存储。图像宽度为 4096 像素,像素尺寸为 0.94 Å。采集总剂量为 50 e-/Ų。这些图像记录了经 D 型肽 D-TLKIVWR 孵育后的 Tau 配对螺旋丝样品,可用于观察短肽对 tau 纤维的解聚作用。主题标签包括阿尔茨海默病、Tau 蛋白、配对螺旋丝、D 型肽、冷冻电镜、神经系统疾病。
【采集与来源】
该数据集来源于电子显微镜公共图像存档库 EMPIAR,编号 EMPIAR-13490,来源站为 ebi.ac.uk。采集方式为冷冻电镜(cryo-EM),以多帧 EER 格式记录,每部电影 1683 个原始帧,总剂量 50 e-/Ų,像素尺寸 0.94 Å,图像宽度 4096 像素。样品为阿尔茨海默病来源的 Tau 配对螺旋丝,经 D 型肽 D-TLKIVWR 孵育处理。其余采集参数,如显微镜型号、加速电压、探测器类型、放大倍数、采集日期等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于阿尔茨海默病中 Tau 蛋白配对螺旋丝的结构研究,尤其是短肽 D-TLKIVWR 对 tau 纤维解聚作用的冷冻电镜分析。可用于单颗粒分析、螺旋重构、纤维结构解析等冷冻电镜图像处理流程。也可用于研究 D 型肽与 Tau 纤维相互作用的形态学变化。此外,该数据集可作为神经系统疾病、阿尔茨海默病及 Tau 蛋白病理相关研究的参考数据。具体适用场景的更多细节,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以多帧 EER 格式提供,每部电影包含 1683 个原始帧,采用无符号字节编码。使用时可按照冷冻电镜图像处理常规流程进行帧对齐、剂量加权、运动校正、CTF 估计、颗粒挑选、二维分类、三维重构等处理。像素尺寸为 0.94 Å,总剂量为 50 e-/Ų,图像宽度为 4096 像素,这些参数可用于图像处理中的物理尺度换算与剂量相关校正。具体处理软件、参数设置及分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集提供了 725.5 张显微图像,每部电影 1683 个原始帧,总剂量 50 e-/Ų,像素尺寸 0.94 Å,图像宽度 4096 像素。数据以无符号字节 EER 格式存储,属于多帧电影数据。关于图像分辨率、信噪比、数据完整性、样品纯度、纤维分布均匀性等质量指标,源站未提供。数据集仅涉及经 D 型肽 D-TLKIVWR 孵育的阿尔茨海默病 Tau 配对螺旋丝样品,未提供其他对照条件或重复实验信息。使用时应结合具体研究目的评估数据适用性。
【引用与许可】
该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 EMPIAR 存档,编号 EMPIAR-13490。关于引用方式、许可协议、使用条款及数据共享政策,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应参考 EMPIAR 源站的相关规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-13490
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMPIAR-13490 Tau Paired Helical Filament from Alzheimer’s Disease incubated with D-peptide D-TLKIVWR 725.5 micrographs - multiframe EER 1208 1683 UNSIGNED BYTE EER format movies with 1683 raw frames per movie. 50 e-/A2 dosage. 4096 0.94 How short peptides disassemble tau fibrils in Alzheimer’s
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