阿尔茨海默病中GRIP1-PDZ6的结构洞察:从蛋白质表达到分子动力学模拟的研究

该数据集包含与阿尔茨海默病相关的蛋白质表达数据、蛋白质相互作用网络分析以及GRIP1-PDZ6二聚体的分子动力学模拟数据,涉及蛋白质结构、动态构象变化等多模态信息。其主要研究方向是通过分析PDZ结构域与Liprin-alpha结合前后的构象差异,探索突触功能障碍在阿尔茨海默病中的分子机制,为神经退行性疾病的治疗策略提供结构生物学依据。

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2017-06-22 更新
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蛋白质结构动态阿尔茨海默病分子机制

基本信息

创建/更新时间
2017-06-22

资源简介

该数据集聚焦于阿尔茨海默病(AD)的分子机制研究,重点关注蛋白质相互作用结构域PDZ在脑内突触传递中的关键作用。数据集包含蛋白质表达数据、蛋白质相互作用网络分析结果以及针对GRIP1-PDZ6二聚体(包括与Liprin-alpha结合及未结合状态)的分子动力学模拟数据(模拟时长为100纳秒)。通过分析溶剂可及表面积(SASA)、氢键模式及主成分1(PC1)等参数,揭示了Liprin-alpha结合如何诱导GRIP1-PDZ6二聚体构象变化,为理解AD病理中突触功能障碍的分子基础提供了结构动态视角。该数据主要应用于神经退行性疾病机制探索、蛋白质结构动力学研究及潜在药物靶点发现。

原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/Structural_insight_into_GRIP1-PDZ6_in_Alzheimer_s_disease_study_from_protein_expression_data_to_molecular_dynamics_simulations/3506327

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数据说明

该数据集聚焦于阿尔茨海默病(AD)的分子机制研究,重点关注蛋白质相互作用结构域PDZ在脑内突触传递中的关键作用。数据集包含蛋白质表达数据、蛋白质相互作用网络分析结果以及针对GRIP1-PDZ6二聚体(包括与Liprin-alpha结合及未结合状态)的分子动力学模拟数据(模拟时长为100纳秒)。通过分析溶剂可及表面积(SASA)、氢键模式及主成分1(PC1)等参数,揭示了Liprin-alpha结合如何诱导GRIP1-PDZ6二聚体构象变化,为理解AD病理中突触功能障碍的分子基础提供了结构动态视角。该数据主要应用于神经退行性疾病机制探索、蛋白质结构动力学研究及潜在药物靶点发现。

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