阿尔茨海默病中GRIP1-PDZ6的结构洞察：从蛋白质表达到分子动力学模拟的研究
该数据集包含与阿尔茨海默病相关的蛋白质表达数据、蛋白质相互作用网络分析以及GRIP1-PDZ6二聚体的分子动力学模拟数据，涉及蛋白质结构、动态构象变化等多模态信息。其主要研究方向是通过分析PDZ结构域与Liprin-alpha结合前后的构象差异，探索突触功能障碍在阿尔茨海默病中的分子机制，为神经退行性疾病的治疗策略提供结构生物学依据。
基本信息
资源简介
阿尔茨海默病中GRIP1-PDZ6的结构洞察：从蛋白质表达到分子动力学模拟的研究
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Structural insight into GRIP1-PDZ6 in Alzheimer’s disease: study from protein expression data to molecular dynamics simulations》。配套论文《Structural insight into GRIP1-PDZ6 in Alzheimer’s disease: study from protein expression data to molecular dynamics simulations》发表于 Journal of Biomolecular Structure and Dynamics（2016），DOI：10.1080/07391102.2016.1214085。源站首次发布：2016-08-01。
【数据内容】
源站原始描述：Protein–protein interaction domain, PDZ, plays a critical role in efficient synaptic transmission in brain. Dysfunction of synaptic transmission is thought to be the underlying basis of many neuropsychiatric and neurodegenerative disorders including Alzheimer’s disease (AD). In this study, Glutamate Receptor Interacting Protein1 (GRIP1) was identified as one of the most important differentially expressed, topologically significant proteins in the protein–protein interaction network. To date, ver…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 770.04 KB。tbsd_a_1214085_sm7387.rar：application/x-rar，770.04 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.3506327.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Biochemistry、Physical Sciences not elsewhere classified、Neuroscience、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：GRIP1、PDZ domain、Alzheimer’s disease、protein expression data、MD simulation。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Physical Sciences not elsewhere classified、Neuroscience、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Structural_insight_into_GRIP1-PDZ6_in_Alzheimer_s_disease_study_from_protein_expression_data_to_molecular_dynamics_simulations/3506327
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Structural insight into GRIP1-PDZ6 in Alzheimer’s disease: study from protein expression data to molecular dynamics simulations. Taylor & Francis. Chatterjee, Paulami; Roy, Debjani
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-04，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于阿尔茨海默病（AD）的分子机制研究，重点关注蛋白质相互作用结构域PDZ在脑内突触传递中的关键作用。数据集包含蛋白质表达数据、蛋白质相互作用网络分析结果以及针对GRIP1-PDZ6二聚体（包括与Liprin-alpha结合及未结合状态）的分子动力学模拟数据（模拟时长为100纳秒）。通过分析溶剂可及表面积（SASA）、氢键模式及主成分1（PC1）等参数，揭示了Liprin-alpha结合如何诱导GRIP1-PDZ6二聚体构象变化，为理解AD病理中突触功能障碍的分子基础提供了结构动态视角。该数据主要应用于神经退行性疾病机制探索、蛋白质结构动力学研究及潜在药物靶点发现。
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