空间蛋白质组学分析揭示阿尔茨海默病人脑微环境依赖性髓系细胞异质性（数据集III）

资源简介

空间蛋白质组学分析揭示阿尔茨海默病人脑微环境依赖性髓系细胞异质性（数据集III）

Spatial proteomic analysis enables identification of microenvironment-dependent myeloid cell heterogeneity in Alzheimer's disease human brain (Dataset III) 是一个面向阿尔茨海默病（Alzheimer's disease, AD）人脑组织空间蛋白质组学研究的公开数据集，属于神经系统疾病／阿尔茨海默病分类下的数据资源。该数据集是 Sanchez-Molina 等人相关研究的数据组成部分之一，主题涵盖阿尔茨海默病、空间蛋白质组学、髓系细胞异质性、微环境、人脑、神经系统疾病以及 CODEX 等方向，旨在为探索人脑微环境依赖性的髓系细胞状态提供数据支撑。数据集由 Ajami, Bahareh 与 Rosmus, Dennis-Dominik 两位作者贡献，机构标注为 Nature Neuroscience，发布时间为 2026 年，来源站为 doi.org。

【数据集背景】

该数据集对应 Sanchez-Molina 等人关于人阿尔茨海默病脑组织空间蛋白质组分析的研究工作，其核心科学问题在于借助空间蛋白质组学手段，识别微环境依赖性的小胶质细胞（髓系细胞）状态。相关研究论文题为 "Spatial proteomic analysis in human Alzheimer's disease brains enables identification of microenvironment-dependent microglial cell states"，数据集本身即为该研究的数据组成部分之一（Dataset III）。研究聚焦于阿尔茨海默病人脑中的髓系细胞异质性，并强调微环境因素在细胞状态形成中的作用，属于神经系统疾病与空间组学交叉的研究方向。

【数据内容】

该数据集为与上述研究相关的第三部分数据。根据源站描述，数据集包含样本标识信息，具体样本 ID 对应关系为：AD 1 对应 3156，AD 2 对应 2997，AD 3 对应 3196，AD 4 对应 3280；Control 1 对应 3026，Control 2 对应 3628，Control 3 对应 1796，Control 4 对应 1873。由此可知，数据集涵盖阿尔茨海默病组与对照组两类样本，每组各 4 例。除样本 ID 键之外，源站未提供关于数据文件类型、图像数量、蛋白标记面板、空间坐标或细胞分割结果等更细粒度的内容说明。

【采集与来源】

数据集的来源站为 doi.org，源站描述中给出了相关研究论文的 DOI 链接（https://doi.org/10.1038/s41593-026-02267-3），并指出相关分析可在 https://github.com/BaharehAjami/CODEX-CNS 获取。作者为 Ajami, Bahareh 与 Rosmus, Dennis-Dominik，机构标注为 Nature Neuroscience，发布时间为 2026 年。关于样本的采集地点、伦理审批、供体临床信息、组织处理流程及成像平台等具体采集细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于阿尔茨海默病人脑空间蛋白质组学相关的研究场景，尤其是围绕髓系细胞（如小胶质细胞）异质性及其与微环境关系的分析。主题标签涵盖阿尔茨海默病、空间蛋白质组学、髓系细胞异质性、微环境、人脑、神经系统疾病与 CODEX，提示其可用于空间细胞状态识别、病例与对照比较等方向。由于数据集包含 AD 与 Control 两组样本的标识信息，也可用于分组对照分析。具体分析流程与可复现的分析代码可参考源站给出的 GitHub 仓库链接。除此之外的适用场景，源站未提供。

【使用方法】

源站描述指出，相关分析可在 https://github.com/BaharehAjami/CODEX-CNS 处获取，并提供了样本 ID 键以便将样本标识与分组对应起来。使用者可依据该样本 ID 键区分 AD 组（AD 1–AD 4）与对照组（Control 1–Control 4）。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、软件依赖与参数设置等具体使用方法，源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、批次效应、样本量充分性、技术偏差或验证结果等方面的说明。已知样本规模为 AD 组 4 例、对照组 4 例，其余质量与限制相关信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集对应 Sanchez-Molina 等人的研究工作，相关论文 DOI 为 https://doi.org/10.1038/s41593-026-02267-3，作者为 Ajami, Bahareh 与 Rosmus, Dennis-Dominik，机构标注为 Nature Neuroscience，发布时间为 2026 年。关于数据集的许可协议、使用条款与具体引用格式，源站未提供。