阿尔茨海默病额叶皮层肌氨酸不溶性组分的 amyloid-β 42 纤维单颗粒冷冻电镜数据集
EMPIAR-10916 单颗粒冷冻电镜数据集，来源于一名阿尔茨海默病患者的额叶皮层肌氨酸不溶性组分，包含 amyloid-β 42 纤维
基本信息
资源简介
阿尔茨海默病额叶皮层肌氨酸不溶性组分的 amyloid-β 42 纤维单颗粒冷冻电镜数据集
该数据集为单颗粒冷冻电镜数据集，英文名称为 Single particle cryo-EM dataset of sarkosyl-insoluble fraction from the frontal cortex of an individual with Alzheimer’s disease of amyloid-β 42 filaments。其样本来源于一名阿尔茨海默病患者的额叶皮层肌氨酸不溶性组分，目标对象为 amyloid-β 42 纤维。数据集收录了未对齐的多帧 movies 显微图像，文件格式为多帧 TIFF，并包含由 EPU 写出的 eer 文件。该数据集在分类上属于神经系统疾病中的阿尔茨海默病方向，来源站为 ebi.ac.uk，对应 EMPIAR-10916。整体而言，该资源可用于围绕阿尔茨海默病相关淀粉样蛋白纤维开展单颗粒冷冻电镜数据处理与结构研究。
【数据集背景】
阿尔茨海默病是常见的神经系统疾病之一，其病理特征涉及淀粉样蛋白沉积和纤维形成。该数据集聚焦于一名阿尔茨海默病患者额叶皮层中的肌氨酸不溶性组分，并针对 amyloid-β 42 纤维进行单颗粒冷冻电镜数据采集。此类数据通常用于研究患者来源纤维的形态和结构特征，为理解疾病相关蛋白聚集提供实验基础。该数据集的分类归属为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病，来源站为 ebi.ac.uk，对应编号 EMPIAR-10916。
【数据内容】
数据集包含未对齐的多帧 movies 显微图像，数量为 531.9，文件格式为多帧 TIFF。源站描述中同时给出 1762、40、UNSIGNED BYTE 等信息，并说明文件由 EPU 写为 eer 文件。该数据集的核心对象是来自一名阿尔茨海默病患者额叶皮层肌氨酸不溶性组分的 amyloid-β 42 纤维。数据以单颗粒冷冻电镜 movies 形式提供，属于未对齐的原始或中间阶段图像数据，可用于后续图像处理、颗粒挑选、对齐和三维重建等流程。
【采集与来源】
样本来源为一名阿尔茨海默病患者的额叶皮层，并经过肌氨酸不溶性组分提取。目标纤维为 amyloid-β 42 纤维。数据采集与文件生成涉及 EPU，文件被写为 eer 文件。来源站为 ebi.ac.uk，数据集对应 EMPIAR-10916。除上述信息外，源站未提供更详细的采集参数、设备型号、放大倍数、像素尺寸、总剂量、采集时间、样本制备细节或伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集适用于单颗粒冷冻电镜数据处理相关场景，尤其是针对阿尔茨海默病来源 amyloid-β 42 纤维的结构研究。研究人员可将其用于 movies 图像的预处理、帧对齐、颗粒挑选、二维分类、三维重构以及纤维结构分析等通用流程。由于样本来自患者额叶皮层肌氨酸不溶性组分，该数据也可用于与淀粉样蛋白纤维相关的病理机制研究、方法学比较或数据处理流程验证。具体适用场景需结合源站说明和实际数据质量判断，源站未提供更细化的推荐用途。
【使用方法】
使用该数据集时，可按照单颗粒冷冻电镜常规流程处理未对齐的多帧 movies 显微图像。由于文件为多帧 TIFF，并包含由 EPU 写出的 eer 文件，使用者需根据自身软件环境选择兼容的读取方式，并进行帧对齐、剂量加权、运动校正、CTF 估计、颗粒挑选和三维重建等步骤。对于 amyloid-β 42 纤维这类丝状结构，通常还需考虑纤维的螺旋对称性和分段处理策略。源站未提供具体软件参数、推荐流程、脚本或处理示例，因此实际使用方法需由使用者根据数据特征自行确定。
【质量与限制】
该数据集为未对齐的多帧 movies 显微图像，意味着数据尚未完成对齐和后续重建处理，使用前通常需要自行进行图像处理。源站描述中给出了 531.9、1762、40、UNSIGNED BYTE 等信息，但未提供分辨率、颗粒数量、数据质量评分、信噪比、缺陷说明或验证结果。该数据集仅来源于一名阿尔茨海默病患者的额叶皮层，样本代表性有限。除源站已提供的信息外，源站未提供更多质量评估、限制说明或偏倚分析。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk，对应 EMPIAR-10916。源站未提供具体的引用格式、文献列表、DOI、许可协议、使用条款或数据共享限制。使用者在引用或再利用该数据集前，应访问来源站查询最新的引用要求和许可信息。除来源站和数据集编号外，源站未提供其他引用与许可细节。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-10916
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMPIAR-10916 阿尔茨海默病患者额叶皮层肌氨酰不溶性组分的单颗粒冷冻电镜数据集，含淀粉样β42纤维 531.9 未对齐多帧电影显微照片 - 多帧TIFF 1762 40 无符号字节 文件由EPU以eer格式写入
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
