多中心队列中Lewy体病与帕金森病的外周免疫单细胞图谱

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A2e697945cd1ae1c1073ba286de549b787c745119f7588ca87ebbdf47d0698092

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景 多条证据支持外周器官在路易体病（LBD）的起始或进展中发挥作用，LBD是一组神经退行性诊断谱系，包括不伴或伴有痴呆的帕金森病（PD）（PDD）以及路易体痴呆（DLB）。然而，外周免疫反应对LBD的潜在贡献仍不清楚。本研究旨在以单细胞分辨率刻画LBD患者特有的外周免疫反应，以突出潜在生物标志物并增进对人类LBD发病机制的理解。方法 在一项病例对照研究中，研究参与者的外周单个核细胞（PBMC）样本从美国多个站点随机采样。诊断组包括健康对照（HC，n=159164）、LBD（n=110132）、阿尔茨海默病痴呆（ADD，n=9798）、其他神经退行性疾病对照（NDC，n=1921）和免疫疾病对照（IDC，n=14）。PBMC经……激活，PBMC通过密度梯度离心分离并冷冻保存。解冻后，细胞在含benzonase的完全RPMI培养基中洗涤。

所有样本经Vi-Cell（Beckman Coulter）测定的细胞活力均高于90%。在37°C静置2小时后，PBMCs或保持未刺激状态，或用一组细胞因子刺激：IFNα（10,000单位/ml）、IL-2（50 ng/ml）、IL-6（50 ng/ml）和LPS（200 ng/ml），于37°C刺激15分钟。通过室温下用多聚甲醛固定细胞10分钟来终止刺激。用PBS洗涤细胞后，样本用LIVE/DEAD™ Fixable Blue Dead Cell Stain Kit（用于紫外激发，购自Invitrogen）在室温下染色15分钟。活死染色后，用洗涤缓冲液（磷酸盐缓冲盐水、2%胎牛血清、0.1%叠氮化钠）洗涤细胞，随后进行表面染色，使用抗CD4（BUV805）、CD7（AF780）、CD8（AF700）、CD11b（BUV395）、CD14（BUV737）、CD16（BV750）、CD19（PerCP-Cy5.5）、CD27（B

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。