恢复海马葡萄糖代谢可挽救阿尔茨海默病病理中的认知功能

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A2ae21c60f802d8189eee0b1e56daa03c406ce527d584100ac08b12dcce7d9316

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑葡萄糖代谢受损是阿尔茨海默病（AD）的一个病理特征，近期蛋白质组学研究突显了随着疾病进展，胶质细胞碳水化合物代谢出现紊乱。在此，我们报告，抑制吲哚胺-2,3-双加氧酶1（IDO1）——该酶在犬尿氨酸通路的第一步中将色氨酸代谢为犬尿氨酸（KYN）——可在淀粉样蛋白和tau蛋白病理的临床前模型中，通过恢复星形胶质细胞对神经元的代谢支持，挽救海马记忆功能和可塑性。在星形胶质细胞中，淀粉样蛋白-β和tau寡聚体（AD的两个主要病理效应物）激活IDO1，以AhR依赖的方式增加KYN并抑制糖酵解。相反，药理学抑制IDO1可恢复糖酵解和乳酸生成。在产生淀粉样蛋白的APPSwe-PS1ΔE9和5XFAD小鼠以及产生tau蛋白的P301S小鼠中，通过代谢组学和MALDI-MS分析，IDO1抑制可恢复空间记忆并改善海马葡萄糖代谢。

从分离的星形胶质细胞和神经元中提取代谢物，使用-80°C的80:20甲醇:水溶液，每1x10^6个细胞使用1.5毫升体积，涡旋混合，在干冰上孵育10分钟，然后以16,000 g离心20分钟，取上清液进行LC-MS分析。提取物在24小时内通过液相色谱-质谱联用（LC-MS）进行分析。LC-MS方法涉及亲水相互作用色谱（HILIC）与Q Exactive PLUS质谱仪（Thermo Scientific）联用（参考文献17）。LC分离在XBridge BEH Amide柱（150 mm x 2.1 mm，2.5 μm粒径，Waters，Milford，MA）上进行。溶剂A为95%:5% H2O:乙腈，含20 mM碳酸氢铵，溶剂B为乙腈。梯度如下：0分钟，85% B；2分钟，85% B；3分钟，80% B；5分钟，80% B；6分钟，75% B；7分钟，75% B；8分钟，70% B；9分钟，70% B；10分钟，50% B；12分钟，50% B；13分钟，25% B；16分钟，25% B；18分钟，0% B；23分钟，0% B；24分钟，85% B。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。