神经生长因子响应元件调控免疫细胞炎症及阿尔茨海默病小鼠模型失调的原始scRNA-seq FASTQ数据

数据与一项研究神经生长因子响应元件调控免疫细胞炎症、并在阿尔茨海默病小鼠模型中失调的项目相关,可用于免疫细胞分型、炎症相关基因表达分析及阿尔茨海默病免疫机制探索(来源 DOI 解析)

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基因组分类InflammationNerve Growth FactorsNervtillväxtfaktorerCholinergic NeuronsKolinerga neuronerImmune cell phenotypingfenotypbestämning av immuncellImmunologyFOS: Clinical medicineImmunologi
Raw scRNA-seq FASTQ data files for: Nerve growth factor responsive elements modulate immune cell inflammation and are dysregulated in an Alzheimer's disease mouse model

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07
版本
1

资源简介

神经生长因子响应元件调控免疫细胞炎症及阿尔茨海默病小鼠模型失调的原始scRNA-seq FASTQ数据

Raw scRNA-seq FASTQ data files for: Nerve growth factor responsive elements modulate immune cell inflammation and are dysregulated in an Alzheimer's disease mouse model

该数据集为野生型C57BL/6J小鼠脾细胞来源的原始单细胞RNA测序FASTQ文件,共2个样本、4个文件,采用10x Genomics Chromium Next GEM Single Cell 3′ Reagent Kit v3.1建库,并在Illumina NextSeq 2000平台测序。数据与一项研究神经生长因子响应元件调控免疫细胞炎症、并在阿尔茨海默病小鼠模型中失调的项目相关,可用于免疫细胞分型、炎症相关基因表达分析及阿尔茨海默病免疫机制探索(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【主题与分类】

主题标签:Inflammation、Inflammation、Nerve Growth Factors、Nervtillväxtfaktorer、Cholinergic Neurons、Kolinerga neuroner、Immune cell phenotyping、fenotypbestämning av immuncell、Immunology、Immunologi。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://researchdata.se/catalogue/dataset/2026-128/1

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含从野生型C57BL/6J小鼠(n = 2)分离的脾细胞中生成的原始单细胞RNA测序(scRNA-seq)FASTQ文件。文库使用10x Genomics Chromium Next GEM Single Cell 3′ Reagent Kit v3.1制备,并在Illumina NextSeq 2000平台上测序。该数据集包含与一项题为“神经生长因子响应元件调节免疫细胞炎症,并在阿尔茨海默病小鼠模型中失调”的研究相关的双端原始测序文件。该数据集包含四(4)个文件:- RGAD_WT_S1_L001_R1_001.fastq.gz 野生型样本1的正向读段 - RGAD_WT_S1_L001_R2_001.fastq.gz 野生型样本1的反向读段 - RGAD_WT1_S1_L001_R1_001.fastq.gz 野生型样本2的正向读段 - RGAD_WT1_S1_L001_R2_001.fastq.gz 野生型样本2的反向读段

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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