基本信息

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基因组

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA77987：GenADA 人类阿尔茨海默病 BioProject

PRJNA77987: GenADA 是一个公开收录于 NCBI BioProject 数据库的人类基因组相关研究项目，其正式名称为 GenADA。该项目在来源站点 NCBI 上以 BioProject 编号 77987 进行标识，所涉及的物种为 Homo sapiens（人类）。在本站的数据分类体系中，该数据集被归入神经系统疾病类别下的阿尔茨海默病方向，主题标签为“Phenotype or Genotype”（表型或基因型）。这意味着该项目围绕人类样本的表型与基因型信息展开，服务于阿尔茨海默病相关研究领域。作为 BioProject 体系中的一项记录，它本身并不直接等同于某一批原始测序数据，而是作为该项目所产生各类生物数据的统一入口，帮助使用者定位和获取与 GenADA 相关的多种数据类型。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的生物数据。按照 NCBI 的说明，一个 BioProject 通常源自某个单一机构或某个联合体，其记录的作用是为用户提供一个统一的查找入口，以便获取该项目所产生的不同类型的数据。PRJNA77987: GenADA 正是在这一框架下建立的项目记录，编号为 77987，项目名称为 GenADA，研究物种为人类。该项目在本站被归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病，说明其研究背景与阿尔茨海默病这一神经退行性疾病相关。关于该项目的具体发起机构、参与单位以及立项时间等背景信息，源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Phenotype or Genotype”，表明其数据内容涉及表型或基因型层面的信息。作为 BioProject 记录，它指向的是围绕 GenADA 项目所生成的多种数据类型，而非单一类型的数据文件。项目所涵盖的具体样本数量、测序平台、数据文件格式、基因分型位点数量、表型字段构成等细节，源站未提供。因此，无法从现有信息中确定该项目包含哪些具体的组学数据或临床表型指标。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）。项目以 BioProject 编号 77987 在该站点登记，项目名称为 GenADA，物种为 Homo sapiens。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批信息以及数据提交者等具体采集与来源细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其分类归属与主题标签，该数据集可适用于与阿尔茨海默病相关的表型与基因型研究场景，例如在神经系统疾病研究中对人类样本的遗传与表型关联进行探索。同时，作为 BioProject 记录，它也可用于检索和定位 GenADA 项目所关联的各类生物数据资源。关于该数据集是否适用于特定分析流程、特定人群或特定统计方法，源站未提供相应说明。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 编号 77987 在来源站点检索该项目的记录，并经由该记录获取与 GenADA 项目相关的数据链接。关于数据下载方式、访问权限、是否需要申请、推荐的分析工具或处理流程等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 项目记录，其作用在于汇集与单一研究计划相关的数据链接。关于数据质量评估指标、样本量大小、数据完整性、批次效应、潜在偏倚以及使用限制等，源站未提供。使用者需注意，BioProject 记录本身并不直接代表某一批具体数据的质量水平。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款、使用协议以及是否需要获得授权等，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA77987

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA77987

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

GenADA是一项多中心合作研究，涉及葛兰素史克公司和加拿大的九个医疗中心，旨在建立一个包含1000名阿尔茨海默病患者和1000名种族匹配对照者的数据集，以便将候选基因中的DNA序列（等位基因）变异与阿尔茨海默病表型相关联。该研究包括回顾性和前瞻性两部分，即既有已确诊阿尔茨海默病的患者，也有新诊断的患者被纳入研究。因此，临床数据是在进入GenADA研究第1天时回顾性或前瞻性获取的。在可能的情况下，还招募了患有阿尔茨海默病的生物学亲属（可达三级亲属关系，如表亲）以及AD病例的未患病兄弟姐妹。请注意，生物学亲属的招募人数低于预期，且这些受试者的基因型数据尚未提交至dbGap。本研究的目的在于……（更多内容请参见dbGaP研究页面。）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别