PRJNA77985:GenADA 人类阿尔茨海默病 BioProject

BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一机构或联盟的一组生物数据集合。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,用于查找为该计划产生的多种数据类型所对应的链接

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其他神经系统疾病阿尔茨海默病BioProjectHomo sapiensNCBI
PRJNA77985: GenADA

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA77985:GenADA 人类阿尔茨海默病 BioProject

PRJNA77985: GenADA 是一个与人类相关的生物项目记录,归属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病这一分类。该项目由 NCBI 的 BioProject 数据库收录,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一机构或联盟的一组生物数据集合,其记录为用户提供一个统一的位置,用于查找为该计划产生的多种数据类型所对应的链接。因此,PRJNA77985: GenADA 可被理解为阿尔茨海默病研究方向上的一个生物数据集合入口,帮助使用者定位与该研究计划相关的各类生物数据资源。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为 PRJNA77985: GenADA,源站标题为“Homo sapiens (ID 77985) - BioProject - NCBI”。从分类上看,它被归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病领域。BioProject 的设立目的,是围绕单一研究计划、来自单一机构或联盟的一组生物数据进行组织与呈现。每一个 BioProject 记录都提供一个统一的位置,使用户能够查找为该计划产生的多种数据类型所对应的链接。因此,PRJNA77985: GenADA 的背景与人类阿尔茨海默病相关研究计划的数据组织与索引有关。

【数据内容】

该数据集属于 BioProject 类型的记录,其核心作用在于汇集与单一研究计划相关的生物数据链接。根据 BioProject 的一般定义,它是一组生物数据的集合,这些数据围绕同一项研究计划,来自单一机构或联盟。BioProject 记录本身为用户提供统一入口,以便查找为该计划产生的多种数据类型所对应的链接。关于 PRJNA77985: GenADA 具体包含哪些数据类型、样本数量、测序平台或分析结果,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题显示其与 Homo sapiens(ID 77985)相关。BioProject 记录通常来自单一组织或联盟,并围绕一个研究计划进行组织。关于 PRJNA77985: GenADA 的具体采集方法、样本来源、伦理审批信息或数据提交机构,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要查找与人类阿尔茨海默病相关研究计划所产生数据链接的场景。由于 BioProject 记录提供统一位置以定位多种数据类型对应的链接,使用者可将其作为入口,进一步访问该研究计划相关的生物数据资源。关于该数据集在具体研究、临床或分析流程中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI 的 BioProject 记录访问该数据集,并利用其提供的统一位置查找与该研究计划相关的多种数据类型链接。关于具体的检索路径、下载方式、API 接口或数据访问权限,源站未提供。

【质量与限制】

BioProject 记录作为生物数据的集合入口,其质量与完整性取决于所链接的数据资源。关于 PRJNA77985: GenADA 的数据质量、覆盖范围、更新频率或使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于 PRJNA77985: GenADA 的引用方式、许可条款或使用条件,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA77985

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

GenADA是一项多中心合作研究,涉及葛兰素史克公司和加拿大的九个医疗中心,旨在建立一个包含1000名阿尔茨海默病患者和1000名种族匹配对照者的数据集,以便将候选基因中的DNA序列(等位基因)变异与阿尔茨海默病表型相关联。该研究包括回顾性和前瞻性两部分,即既有已确诊阿尔茨海默病的患者,也有新诊断的患者被纳入研究。因此,临床数据是在进入GenADA研究第1天时回顾性或前瞻性获取的。在可能的情况下,还招募了患有阿尔茨海默病的生物学亲属(可达三级亲属关系,如表亲)以及AD病例的未患病兄弟姐妹。请注意,生物学亲属的招募人数低于预期,且这些受试者的基因型数据尚未提交至dbGap。本研究的目的在于……(更多内容请参见dbGaP研究页面。)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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