PRJNA157245:阿尔茨海默病遗传学联盟
数据聚焦人类样本,主题标签为 Phenotype or Genotype,本站归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病。BioProject 记录汇集了由单一组织或联盟发起的同一计划所产生的多种生物数据类型,并提供统一入口链接到该项目生成的不同数据

基本信息
资源简介
PRJNA157245:阿尔茨海默病遗传学联盟
PRJNA157245 是一个以阿尔茨海默病遗传学研究为核心的 BioProject 数据集,英文全称为 Alzheimer's Disease Genetics Consortium,对应 NCBI BioProject 数据库中编号为 157245 的人类(Homo sapiens)项目记录。该数据集在分类上归属于神经系统疾病下的阿尔茨海默病,主题标签为 Phenotype or Genotype,表明其内容围绕人类样本的表型或基因型信息展开。BioProject 作为生物数据的集合性记录,旨在汇集由单一组织或联盟发起的同一项研究计划所产生的多种数据类型,并为用户提供统一入口,以便访问该项目生成的不同类型数据。因此,该数据集适合作为阿尔茨海默病遗传学研究的资源入口,帮助研究者定位与该项目相关的生物数据。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库,项目编号为 PRJNA157245,英文名称为 Alzheimer's Disease Genetics Consortium。从名称和分类来看,该项目与阿尔茨海默病的遗传学研究相关,属于神经系统疾病范畴。BioProject 的设计初衷是围绕某一具体研究计划,将来自单一组织或联盟的多种生物数据进行集中组织。对于阿尔茨海默病这类复杂疾病而言,遗传学研究通常涉及大量人类样本,并需要整合表型与基因型等多层次信息。该数据集的主题标签为 Phenotype or Genotype,说明其关注点在于人类样本的表型或基因型数据。源站未提供该项目的具体发起机构、联盟成员、研究时间跨度以及样本规模等细节。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Phenotype or Genotype,表明其内容涉及表型或基因型相关信息。作为 BioProject 记录,它并不一定直接存储所有原始数据,而是提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接。源站描述指出,BioProject 记录为用户提供一个统一位置,以查找与该项目相关的多样化数据类型。因此,该数据集的内容可能涵盖与阿尔茨海默病遗传学研究相关的多种生物数据,但源站未提供具体的数据类型列表、文件格式、数据量或样本数量等信息。该数据集聚焦于人类样本,物种为 Homo sapiens。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 的 BioProject 数据库。项目编号为 PRJNA157245,源站标题为“Homo sapiens (ID 157245) - BioProject - NCBI”。根据源站描述,BioProject 记录来源于单一组织或联盟发起的同一项研究计划。该数据集的具体采集方法、样本收集地点、伦理审批信息以及数据生成平台等,源站未提供。本站将其归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病,主题标签为 Phenotype or Genotype。
【适用场景】
该数据集适用于需要查找或访问阿尔茨海默病遗传学相关生物数据的场景。由于其为 BioProject 记录,可作为统一入口,帮助研究者定位由同一计划产生的多种数据类型。主题标签为 Phenotype or Genotype,意味着它可能适用于关注人类样本表型或基因型信息的研究。该数据集也可用于了解阿尔茨海默病遗传学联盟项目的整体数据组织方式。然而,源站未提供具体的适用分析类型、研究问题或应用案例,因此无法进一步说明其具体用途。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 PRJNA157245 的记录,英文名称为 Alzheimer's Disease Genetics Consortium。该记录提供统一入口,链接到该项目生成的不同数据类型。源站未提供具体的数据下载方式、访问权限、API 接口或分析工具等信息。因此,关于如何具体使用该数据集中的各项数据,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集作为 BioProject 记录,其质量与限制信息源站未提供。源站未提供数据完整性、准确性、更新频率、版本信息或已知偏差等细节。由于该数据集聚焦于人类样本,可能涉及隐私或伦理限制,但源站未提供具体说明。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 的通用条款以及该项目记录中可能提供的附加信息。
【引用与许可】
该数据集的引用方式与许可信息源站未提供。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用限制。用户在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 数据库的通用引用指南以及该项目记录中可能提供的许可声明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA157245
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
美国国家老龄化研究所(NIA)阿尔茨海默病中心(ADCs)队列包括由29个NIA资助的ADC的临床和神经病理学核心部门确定和评估的受试者。数据收集由国家阿尔茨海默病协调中心(NACC)协调。NACC协调从29个ADC收集表型数据,清理所有数据,协调实施AD病例和对照的定义,并协调样本收集。ADC队列包括尸检确认和临床确认的AD病例,以及具有完整神经病理学数据、死亡年龄大于60岁的认知正常老年人(CNEs),还有使用统一数据集(UDS)协议评估的存活CNEs,这些CNEs被记录为没有轻度认知障碍(MCI),评估时年龄在60至100岁之间。ADCs发送了来自尸检受试者的冷冻组织,以及来自部分尸检受试者和存活受试者的DNA样本…(更多信息请参见dbGaP研究页面。)
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
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