第二部分:阿尔茨海默病死者三个脑区Aβ沉积机器学习量化的临床与病理相关性数据-84506
该数据集来自search.dataone.org,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类,包含273名经病理诊断为阿尔茨海默病个体的额叶、颞叶和顶叶皮层组织切片,共生成799张全切片图像

基本信息
资源简介
第二部分:阿尔茨海默病死者三个脑区Aβ沉积机器学习量化的临床与病理相关性数据
Part 2: Data from: Clinical and pathologic correlations of machine learning quantification of Aβ deposits across three brain Regions of decedents with Alzheimer's disease
该数据集来自search.dataone.org,属于神经系统疾病/阿尔茨海默病分类,包含273名经病理诊断为阿尔茨海默病个体的额叶、颞叶和顶叶皮层组织切片,共生成799张全切片图像。数据量化了核心斑块、弥漫斑块和脑淀粉样血管病的密度,并关联临床、人口学和遗传因素。经对数转换后采用混合效应模型分析,发现顶叶核心斑块密度最高,颞叶弥漫斑块密度最高。该数据可用于神经病理学机器学习量化研究,支持阿尔茨海默病病理特征与临床表型的关联分析(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):机器学习的出现使得神经病理学的可扩展量化成为可能,为阿尔茨海默病(AD)提供了更深入的表型分析。在这项研究中,我们量化了多个脑区的淀粉样蛋白β(Aβ)沉积,并检查了它们在病理诊断为AD的个体中与临床、人口学和遗传因素的关联。我们分析了来自三个阿尔茨海默病研究中心的273名个体的核心斑块、弥漫斑块和脑淀粉样血管病(CAA)的密度(#/mm2)。对额叶、颞叶和顶叶皮层的福尔马林固定石蜡包埋切片进行免疫染色和数字化,生成799张全切片图像(WSIs)。经对数转换后,混合效应模型显示顶叶皮层具有最高的核心斑块密度(p < 0.001),而颞叶皮层具有最高的弥漫斑块密度(p < 0.0
【主题与分类】
主题标签:Neuropathology、Machine learning、Artificial intelligence、Alzheimer's disease、Computer vision。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A05d9a278d27260c454d7bd6fd784e0315015bbb54f5b15d1107da469b1686e41
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
机器学习的出现使得神经病理学的规模化量化成为可能,为阿尔茨海默病(AD)提供了更深层的表型分析。在本研究中,我们量化了多个脑区的β-淀粉样蛋白(Aβ)沉积,并检验了其在病理诊断为AD的个体中与临床、人口学和遗传因素的关联。我们分析了来自三个阿尔茨海默病研究中心的273名个体的核心斑块、弥漫斑块和脑淀粉样血管病(CAA)的密度(#/mm²)。对额叶、颞叶和顶叶皮层的福尔马林固定石蜡包埋切片进行免疫染色并数字化,生成799张全切片图像(WSIs)。经对数转换后,混合效应模型显示,顶叶皮层的核心斑块密度最高(p < 0.001),而颞叶皮层的弥漫斑块密度最高(p < 0.001);CAA未显示区域差异。
Wilcoxon秩和检验和协变量调整线性模型…,# 第2部分:数据来源:阿尔茨海默病死者三个脑区Aβ沉积机器学习量化的临床和病理相关性 数据集DOI:10.5061/dryad.wstqjq30t ## 数据和文件结构说明 # UC Davis ADRC RO1全切片图像(WSI)数据集(第2部分) ## 数据集说明 本数据集包含用于以下研究的Aβ免疫染色人脑组织全切片图像(WSI):阿尔茨海默病死者三个脑区Aβ沉积机器学习量化的临床和病理相关性。 由于文件大小限制,完整的WSI数据集分为两部分提供: * 第1部分 - 批次1至9 * 第2部分 - 批次10至12 各部分内容不重叠。用户应下载第1部分和第2部分以获取完整的WSI集合。 — ## 全切片图像详情 * **WSI总数:*…
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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