活体人类小胶质细胞单细胞RNA测序数据集
该数据集来自活体人类小胶质细胞的单细胞RNA-seq，样本取自尸检和手术切除的脑组织，共包含17名个体的16,245个细胞，其中16,099个（99%）为推定小胶质细胞，其余为推定淋巴细胞、单核细胞和红细胞
基本信息
资源简介
活体人类小胶质细胞单细胞RNA测序数据集
该数据集来自活体人类小胶质细胞的单细胞RNA-seq，样本取自尸检和手术切除的脑组织，共包含17名个体的16,245个细胞，其中16,099个（99%）为推定小胶质细胞，其余为推定淋巴细胞、单核细胞和红细胞。尸检供者均患有轻度认知障碍或阿尔茨海默病，手术供者均诊断为颞叶癫痫。组织涵盖背外侧前额叶皮层和颞叶皮层，检测平台为10x 3' v2。数据可用于神经系统疾病中小胶质细胞异质性及细胞类型分类研究（来源 cellxgene.cziscience.com）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该单细胞RNA-seq数据集由从尸检和手术切除的人类脑组织中分离的活体小胶质细胞生成，如Olah等人（Nature Communications，2020）所述。数据集包含来自17名个体的16,245个细胞，其中16,099个（99%）为推定小胶质细胞（聚类1-9），其余细胞为推定淋巴细胞、单核细胞和红细胞。尸检供者均患有轻度认知障碍或诊断为阿尔茨海默病，而手术组织供者均诊断为颞叶癫痫。疾病：阿尔茨海默病、颞叶癫痫。组织：背外侧前额叶皮层、颞叶皮层。检测：10x 3' v2。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。
【主题与分类】
主题标签：Alzheimer disease、temporal lobe epilepsy。本站分类：神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面：https://cellxgene.cziscience.com/collections/fcb3d1c1-03d2-41ac-8229-458e072b7a1c
下载信息
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数据集获取
源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/fcb3d1c1-03d2-41ac-8229-458e072b7a1c
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该单细胞RNA测序数据集来源于从尸检和手术切除的人脑组织中分离出的活体小胶质细胞，如Olah等人（Nature Communications，2020）所述。该数据集包含来自17个个体的16,245个细胞，其中16,099个（99%）为推定的小胶质细胞（聚类1-9），其余细胞为推定的淋巴细胞、单核细胞和红细胞。尸检供者均患有轻度认知障碍或被诊断为阿尔茨海默病，而手术组织供者均被诊断为颞叶癫痫。疾病：阿尔茨海默病、颞叶癫痫。组织：背外侧前额叶皮层、颞叶皮层。检测方法：10x 3‘ v2。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
