Jax.IU.Pitt_Rat_TgF344-AD 研究数据集
Jax.IU.Pitt_Rat_TgF344-AD 研究 这是一项关于家族性阿尔茨海默病转基因大鼠模型的研究。两个转基因均由小鼠朊蛋白启动子驱动（Cohen et al., 2013）
基本信息
资源简介
Jax.IU.Pitt_Rat_TgF344-AD 研究数据集
Jax.IU.Pitt_Rat_TgF344-AD 是一项围绕家族性阿尔茨海默病转基因大鼠模型展开的研究数据集，归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向，来源站为 synapse.org。该研究以 TgF344-AD 大鼠为核心对象，这类大鼠同时表达携带瑞典突变（KM670/671NL）的人源 APP 以及携带 Δ exon 9 突变的人源 PSEN1，两个转基因均由小鼠朊蛋白启动子驱动。与内源性大鼠蛋白水平相比，TgF344-AD 大鼠脑内人源 APP 表达量约为 2.6 倍，人源 PSEN1 表达量约为 6.2 倍。该模型呈现出随年龄增长的病理变化特征，在 6 至 26 月龄之间，可检测到去垢剂可溶性与去垢剂不溶性 Aβ40 和 Aβ42 水平的升高，且 Aβ42/Aβ40 比值随年龄增加。整体而言，该数据集为研究家族性阿尔茨海默病的转基因大鼠模型提供了基础资源。
【数据集背景】
该数据集对应的研究聚焦于家族性阿尔茨海默病的转基因大鼠模型。TgF344-AD 大鼠表达携带瑞典突变（KM670/671NL）的人源 APP，以及携带 Δ exon 9 突变的人源 PSEN1。两个转基因均由小鼠朊蛋白启动子驱动。这一模型的设计与构建参考了 Cohen 等人 2013 年的工作。与内源性大鼠蛋白水平相比，TgF344-AD 大鼠脑内人源 APP 表达量为 2.6 倍，人源 PSEN1 表达量为 6.2 倍。该模型可用于观察与阿尔茨海默病相关的年龄依赖性病理改变。
【数据内容】
源站描述提及，TgF344-AD 大鼠在 6 至 26 月龄之间表现出年龄依赖性的去垢剂可溶性与去垢剂不溶性 Aβ40 和 Aβ42 水平升高，并且 Aβ42/Aβ40 比值随年龄增加。源站描述在此处中断，未提供更完整的数据内容说明。除上述信息外，该数据集具体包含哪些数据文件、字段、样本数量、时间点、检测指标等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 synapse.org。其研究对象为 TgF344-AD 转基因大鼠模型，相关模型背景信息引用了 Cohen 等人 2013 年的研究。关于具体的采集方法、采集机构、采集时间、样本处理流程、伦理审批信息等，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于围绕家族性阿尔茨海默病转基因大鼠模型的研究场景，尤其是涉及人源 APP 与 PSEN1 转基因表达、Aβ40 与 Aβ42 水平变化以及 Aβ42/Aβ40 比值随年龄变化等方向的分析。由于源站描述仅覆盖模型构建背景与部分病理特征，其他具体适用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件组织格式、分析流程、配套代码或工具等均未说明。
【质量与限制】
源站描述中提及的表达倍数、Aβ 水平变化及 Aβ42/Aβ40 比值变化均引用自 Cohen 等人 2013 年的研究。源站描述在 Aβ42/Aβ40 比值随年龄增加处中断，未给出完整结论。关于数据质量评估、批次效应、样本量、统计效力、潜在偏差等信息，源站未提供。
【引用与许可】
源站描述中引用了 Cohen 等人 2013 年的论文，用于说明 TgF344-AD 大鼠模型的构建与特征。关于该数据集的具体引用格式、许可协议、使用条款与数据共享限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn20730014
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
###The Jax.IU.Pitt_Rat_TgF344-AD Study This is a study of a familial Alzheimer’s disease transgenic rat model. TgF344-AD rats express human APP with the Swedish mutation (KM670/671NL) and human PSEN1 with the Δ exon 9 mutation. Both transgenes are driven by the mouse prion promoter (Cohen et al., 2013). Compared with levels of the endogenous rat proteins, TgF344-AD rats express 2.6 times more human APP and 6.2 times more human PSEN1 in the brain (Cohen et al., 2013). TgF344-AD rats show age-dependent increases in levels of detergent-soluble and detergent-insoluble Aβ40 and Aβ42 between 6 and 26 months; the Aβ42/Aβ40 ratio increases with age in the soluble fraction but decreases in the insoluble fraction (Cohen et al., 2013). See additional information on the Rat Resource and Research Center Website or the TgF344-AD page on ALZFORUM. Show More Animals were bred in the Lab Animal Resource Center at Indiana University and maintained in a 12/12-hour light/dark cycle. To minimize gene expression variation between rats, all rats in experimental cohorts were bred in the same rat room and were aged together (to the extent possible). Littermate rats from 3 and 6 months old were used in this study; females and males were assessed. All rats were fed Teklad 4% chow. Standard bedding is sani-chips. MODEL-AD The data in this study are being released as part of MODEL-AD (Model Organism Development & Evaluation for Late-Onset Alzheimer’s Disease) consortium. MODEL-AD seeks to deve
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
