死后阿尔茨海默病脑内β-淀粉样蛋白与tau的原位cryoET
主题标签:阿尔茨海默病、β-淀粉样蛋白、tau、cryoET、死后脑组织、神经系统疾病、EMPIAR-12088。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病

基本信息
资源简介
死后阿尔茨海默病脑内β-淀粉样蛋白与tau的原位cryoET
该数据集为 EMPIAR-12088,英文名称为 In situ cryoET of beta-amyloid and tau in post-mortem Alzheimer's disease brain,来源站为 ebi.ac.uk,本站分类归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。数据集围绕阿尔茨海默病死后脑组织中 β-淀粉样蛋白与 tau 蛋白的原位冷冻电子断层扫描(cryoET)展开,主题标签包括阿尔茨海默病、β-淀粉样蛋白、tau、cryoET、死后脑组织、神经系统疾病以及 EMPIAR-12088。源站描述中提及 127.0 个非痴呆对照的断层扫描重建体积,格式为 MRC,数据类型为 8 位、32 位浮点,图像尺寸为 1024,像素尺寸为 9.6。该数据集可用于观察死后阿尔茨海默病脑组织中 β-淀粉样蛋白和 tau 的原位结构信息,相关作者包括 Gilbert MAG、Fatima N、Jenkins J、O'Sullivan 等。
【数据集背景】
该数据集聚焦于阿尔茨海默病这一神经系统疾病。阿尔茨海默病是常见的神经退行性疾病,其病理特征常涉及 β-淀粉样蛋白与 tau 蛋白的异常聚集。数据集英文名称明确指向死后阿尔茨海默病脑组织中 β-淀粉样蛋白和 tau 的原位 cryoET 研究,主题标签也涵盖阿尔茨海默病、β-淀粉样蛋白、tau、cryoET、死后脑组织及神经系统疾病。本站将其分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。源站描述中列出了 EMPIAR-12088 这一编号,并提及 CryoET of β-amyloid and tau within postmortem Alzheimer's disease brain 以及相关作者 Gilbert MAG、Fatima N、Jenkins J、O'Sullivan。关于该数据集的具体研究背景、立项动机及科学问题的详细说明,源站未提供。
【数据内容】
源站描述显示,该数据集包含 127.0 个非痴呆对照的断层扫描重建体积。数据格式为 MRC,数据类型标注为 8 位、32 位浮点,图像尺寸为 1024,像素尺寸为 9.6。数据集主题涉及 β-淀粉样蛋白与 tau 在死后阿尔茨海默病脑组织中的原位 cryoET 观察。除上述信息外,关于数据集中具体包含哪些图像、体积、标注、分割结果或衍生数据,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中标注编号为 EMPIAR-12088。数据采集对象为死后阿尔茨海默病脑组织,涉及 β-淀粉样蛋白与 tau 的原位 cryoET。源站描述提及 127.0 个非痴呆对照的断层扫描重建体积。关于采集设备、采集参数、成像条件、样本制备流程、伦理审批信息及具体采集时间地点,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病相关研究,尤其是围绕 β-淀粉样蛋白、tau、cryoET 及死后脑组织的原位结构观察。主题标签涵盖阿尔茨海默病、β-淀粉样蛋白、tau、cryoET、死后脑组织、神经系统疾病和 EMPIAR-12088。源站描述中提及非痴呆对照的断层扫描重建体积,因此可用于对照相关的断层扫描数据查看与分析。关于具体适用分析任务、可支持的疾病机制研究或药物研发场景,源站未提供。
【使用方法】
该数据集的数据格式为 MRC,数据类型为 8 位、32 位浮点,图像尺寸为 1024,像素尺寸为 9.6。使用者可依据 MRC 格式及相应数据类型进行读取与处理。源站描述提及断层扫描重建体积,因此使用方向可能涉及断层扫描重建体积的查看与分析。关于具体软件、处理流程、重建参数、可视化方法及分析步骤,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述中列出 127.0 个非痴呆对照的断层扫描重建体积,格式为 MRC,数据类型为 8 位、32 位浮点,图像尺寸为 1024,像素尺寸为 9.6。关于数据质量评估、分辨率指标、信噪比、缺失情况、批次效应、样本代表性及使用限制,源站未提供。该数据集涉及死后脑组织,相关解释需结合具体研究设计,但源站未提供进一步说明。
【引用与许可】
源站描述中提及相关作者 Gilbert MAG、Fatima N、Jenkins J、O'Sullivan,以及数据集编号 EMPIAR-12088。关于引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策及版权信息,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-12088
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMPIAR-12088 阿尔茨海默病死后脑组织中β-淀粉样蛋白和tau蛋白的原位冷冻电子断层扫描 127.0 非痴呆对照组断层扫描重建体积 MRC 61 8 32 位浮点 1024 9.6 阿尔茨海默病死后脑组织中β-淀粉样蛋白和tau蛋白的冷冻电子断层扫描 Gilbert MAG, Fatima N, Jenkins J, O’Sullivan
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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