IDR idr0066-voigt-mesospim 实验B 细胞组织成像数据集

主题标签:神经系统疾病、阿尔茨海默病、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病

idr
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图像图像分割神经系统疾病阿尔茨海默病细胞成像组织成像IDROMEEMBL-EBI
IDR idr0066-voigt-mesospim (experimentB)

基本信息

模态
图像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

IDR idr0066-voigt-mesospim 实验B 细胞组织成像数据集

IDR idr0066-voigt-mesospim (experimentB) 是一个收录于 Image Data Resource(IDR)的细胞与组织成像研究数据集,主题聚焦于神经系统疾病中的阿尔茨海默病。该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,属于经策展的成像研究资源,遵循 OME 与 EMBL-EBI 相关规范。其源站描述标明该研究为 IDR study idr0066-voigt-mesospim 的 experimentB 部分,包含 2 幅图像。本站将其归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病分类,相关主题标签涵盖神经系统疾病、阿尔茨海默病、细胞成像、组织成像、IDR、OME 与 EMBL-EBI。整体而言,该数据集面向阿尔茨海默病相关的细胞与组织成像研究,规模较小,适合作为特定实验环节的成像数据参考。

【数据集背景】

该数据集属于 IDR 平台中编号为 idr0066-voigt-mesospim 的研究,具体为其中的 experimentB 实验部分。IDR 是面向细胞与组织成像研究的策展型数据资源,与 OME、EMBL-EBI 相关。本站将该数据集归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病分类,说明其研究背景与神经系统疾病中的阿尔茨海默病相关。源站描述将其界定为 curated cell/tissue imaging study,即经过策展的细胞/组织成像研究。关于该研究的具体科学问题、实验假设、疾病模型或样本背景,源站未提供。

【数据内容】

该数据集包含 2 幅图像。其主题标签包括神经系统疾病、阿尔茨海默病、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。从标签可以看出,数据内容涉及细胞成像与组织成像,并与阿尔茨海默病这一神经系统疾病主题相关。关于图像的具体模态、分辨率、通道数、染色方式、视野大小、样本类型、时间序列信息或三维结构等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource。源站描述标明其为 IDR study idr0066-voigt-mesospim 的 experimentB 部分,属于 curated cell/tissue imaging study,并涉及 OME 与 EMBL-EBI。关于具体的采集仪器、成像参数、样本制备方法、实验条件、采集时间与地点等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与本站分类,该数据集适用于与神经系统疾病、阿尔茨海默病相关的细胞成像与组织成像研究场景,也可作为 IDR 平台中经策展成像研究的参考数据。其细胞与组织成像属性可能适用于图像分析、方法验证或教学演示等通用用途。关于该数据集在具体研究中的适用性、可重复性验证或与其他数据集的联合分析,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 idr.openmicroscopy.org 访问,具体为 IDR study idr0066-voigt-mesospim 的 experimentB 部分。作为 IDR 资源的一部分,其使用可能遵循 OME 与 EMBL-EBI 相关规范。关于下载方式、数据格式、访问权限、是否需要登录、是否提供 API 或批量获取途径等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 平台中经策展的细胞/组织成像研究,来源站标明其为 curated cell/tissue imaging study。其图像数量为 2 幅,规模较小。关于图像质量、分辨率、信噪比、标注完整性、元数据丰富程度、潜在偏差或使用限制等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,属于 IDR study idr0066-voigt-mesospim 的 experimentB 部分,并与 OME、EMBL-EBI 相关。关于具体的引用格式、许可协议、使用条款或版权归属等,源站未提供。

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源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-852

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0066-voigt-mesospim. Experiment: experimentB. Images: 2. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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