GSE330857：RXRβ信号及其激动剂bexarotene促进非洲爪蟾胚胎神经元形成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330857

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数据说明

视黄酸通过RAR/RXR核受体发挥作用，是非洲爪蟾神经元分化所必需的。贝沙罗汀作为一种泛RXR激动剂，在小鼠模型中通过清除淀粉样斑块和促进神经发生来减轻阿尔茨海默病（AD）的症状。在本文中，我们证明RXR启动的贝沙罗汀信号在正常的非洲爪蟾发育过程中以及在BMP信号被抑制的外胚层外植体中均能产生额外的神经元。通过比较取自未注射胚胎的外胚层外植体与共注射了表达Noggin（一种BMP拮抗剂）和RXRβ的mRNA的胚胎外植体之间的差异基因表达，我们鉴定出了介导从表皮命运向神经命运转变的基因。这些外植体表达与前部神经命运相关的基因，但不表达与神经元命运相关的基因。向等效的共注射外植体中加入贝沙罗汀可激活促进神经元分化和后部特征的基因，包括经典Wnt信号通路的基因。因此，非洲爪蟾外胚层外植体为鉴定促进神经元分化的新型维甲酸类激动剂提供了一种简便高效的工具。

对贝沙罗汀作出反应而表达的基因，与一条与标准维甲酸类信号传导相关的神经元分化通路相一致。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。