神经元GPCR通过修饰神经肽信号抑制远端组织蛋白稳态的数据集 [AM140]
源站描述显示研究围绕神经元 GPCR gtr-1 的 RNAi 敲低机制,涉及神经肽编码基因表达调控及蛋白毒性聚集的改变,可用于探索跨组织通讯与蛋白稳态相关神经退行性疾病的表达特征(来源 NC
![GSE318419: A Neuronal GPCR Modifies Neuropeptide Signaling to Suppress Proteostasis in distal tissues [AM140]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/146548.jpg)
基本信息
资源简介
神经元GPCR通过修饰神经肽信号抑制远端组织蛋白稳态的数据集 [AM140]
A Neuronal GPCR Modifies Neuropeptide Signaling to Suppress Proteostasis in distal tissues [AM140]
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,标题为 A Neuronal GPCR Modifies Neuropeptide Signaling to Suppress Proteostasis in distal tissues [AM140],归类于神经系统疾病与阿尔茨海默病。数据包含 1 个文件(GSE318419_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序进行表达谱分析,物种为 6239,平台为 GPL26672。源站描述显示研究围绕神经元 GPCR gtr-1 的 RNAi 敲低机制,涉及神经肽编码基因表达调控及蛋白毒性聚集的改变,可用于探索跨组织通讯与蛋白稳态相关神经退行性疾病的表达特征(来源 NC。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 04 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):蛋白稳态网络(PN)通过促进多种细胞活动来保障蛋白质的完整性。然而,随着衰老,PN 的能力下降,聚集的蛋白质在细胞内累积。这一过程可能是神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和亨廷顿病)发生的基础。尽管 PN 的活动发生在细胞内,但该网络在整个生物体中通过组织间通讯受到调控,而组织间通讯部分由神经元支配。我们此前发现,降低 gtr-1(编码一种神经元 GPCR)的表达可保护线虫免受导致阿尔茨海默病的 Aβ 肽的毒性。在此,我们研究了 gtr-1 敲低所作用的机制,发现 gtr-1 RNAi 处理调节神经肽编码基因的表达,差异性地改变蛋白毒性聚集
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL26672、6239。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318419
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 09 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318419
标准获取流程:
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
蛋白质稳态网络(PN)通过促进多种细胞活动来保障蛋白质的完整性。然而,随着衰老,PN的能力下降,聚集的蛋白质在细胞内积累。这一过程可能是神经退行性疾病发展的基础,例如阿尔茨海默病和亨廷顿病。尽管PN的活动发生在细胞内,但该网络通过组织间通讯在整个生物体范围内受到调控,而组织间通讯部分由神经元主导。我们此前发现,降低gtr-1(编码一种神经元GPCR)的表达可保护线虫免受导致阿尔茨海默病的Aβ肽的毒性。在此,我们研究了gtr-1敲低所作用的机制,发现gtr-1 RNAi处理可调节神经肽编码基因的表达,差异性改变蛋白毒性蛋白的聚集,并增强蛋白质降解。这些发现凸显了神经肽作为整个生物体蛋白质稳态协调者的作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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