线虫衰老及daf-16(mu86)突变体基因表达变化数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329137

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

衰老的特征是恢复力持续下降和疾病风险增加，导致功能逐渐衰退，最终死亡。大多数关于衰老转录组的研究集中于干预措施能否逆转衰老转录组，而衰老转录组的动态变化却被忽视。我们生成了一个转录组数据集，以研究衰老的分子动态以及胰岛素/IGF-1信号在调控年龄相关基因表达变化中的作用。利用秀丽隐杆线虫，我们对野生型（N2）和daf-16(mu86)突变动物在成年期的多个时间点进行了RNA测序，这些突变动物缺乏胰岛素/IGF-1信号下游的关键FOXO转录因子。该数据集捕获了与生理性衰老相关的时间性基因表达变化，并能够比较正常衰老与应激反应信号受损的情况。样本在确定的成年阶段收集，提取总RNA用于高通量测序。

差异表达及下游分析可用于识别与衰老相关的转录程序，区分适应性基因表达变化与潜在致病性变化，并刻画依赖于daf-16的调控网络。这些数据为研究衰老的系统级架构、基准测试转录组衰老时钟，以及识别与长寿和应激反应相关的基因模块提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。