冬眠与阿尔茨海默病大脑共同转录变化数据集

该数据集来自 NCBI GEO(GSE304024),主题为冬眠与阿尔茨海默病期间大脑的共同转录变化。研究对金仓鼠海马进行单核 RNA 测序,覆盖冬眠周期中各类细胞尤其是胶质细胞的转录变化,并观察到线粒体与核糖体基因的共同变化及小胶质细胞的炎症样反应

geo
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基因组分类GPL3607310036
GSE304024: Common transcriptional changes in the brain during hibernation and Alzheimer’s disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

冬眠与阿尔茨海默病大脑共同转录变化数据集

Common transcriptional changes in the brain during hibernation and Alzheimer’s disease

该数据集来自 NCBI GEO(GSE304024),主题为冬眠与阿尔茨海默病期间大脑的共同转录变化。研究对金仓鼠海马进行单核 RNA 测序,覆盖冬眠周期中各类细胞尤其是胶质细胞的转录变化,并观察到线粒体与核糖体基因的共同变化及小胶质细胞的炎症样反应。数据可用于比较冬眠与阿尔茨海默病相关细胞状态、探索神经保护机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):冬眠需要大脑快速适应,涉及在蛰伏期间代谢率降低的循环,随后是短暂的觉醒期。先前的研究表明,冬眠诱导 Tau 过度磷酸化急剧增加,但与疾病的机制联系仍不清楚。利用对金仓鼠海马的单核 RNA 测序,我们揭示了冬眠周期中所有细胞类型的大规模转录变化,尤其是胶质细胞。在所有不同细胞类型中观察到线粒体和核糖体基因的共同转录变化。此外,冬眠在小胶质细胞中触发炎症样反应,部分类似于在阿尔茨海默病中观察到的细胞状态,但此处没有 Aβ 积累和神经退行性变。这些发现揭示了可能有助于在极端条件下维持重要功能的大脑转化,以及

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL36073、10036。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304024

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 03 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304024

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

冬眠需要大脑快速适应,涉及冬眠期间代谢率降低的循环,随后是短暂的觉醒期。先前的研究表明,冬眠会诱导Tau蛋白过度磷酸化急剧增加,但其与疾病的机制联系仍不清楚。通过对金仓鼠海马进行单核RNA测序,我们揭示了所有细胞类型(尤其是胶质细胞)在冬眠周期中发生的大规模转录变化。在所有不同细胞类型中均观察到线粒体和核糖体基因的共同转录变化。此外,冬眠在小胶质细胞中触发类似炎症的反应,部分类似于在阿尔茨海默病中观察到的细胞状态,但此处没有Aβ积累和神经退行性变。这些发现揭示了可能有助于在极端条件下维持重要功能的大脑转化,并提示AD中的早期细胞变化可能是一种自然的适应过程。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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