Weissella confusa Wc1982 改善仓鼠高脂血症的肝脏转录组数据

该数据集来自 NCBI GEO,包含 Golden Syrian 仓鼠肝脏 RNA 测序数据,用于研究人粪便来源候选益生菌 Weissella confusa Wc1982 对高脂饮食诱导高脂血症的改善作用

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基因组回归GPL2899710036
GSE336151: Weissella confusa Wc1982 ameliorates hyperlipidemia through gut microbiota remodeling and hepatic PPARα/NF-κB signaling in hamsters

基本信息

模态
基因组
任务类型
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创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

Weissella confusa Wc1982 改善仓鼠高脂血症的肝脏转录组数据

Weissella confusa Wc1982 ameliorates hyperlipidemia through gut microbiota remodeling and hepatic PPARα/NF-κB signaling in hamsters

该数据集来自 NCBI GEO,包含 Golden Syrian 仓鼠肝脏 RNA 测序数据,用于研究人粪便来源候选益生菌 Weissella confusa Wc1982 对高脂饮食诱导高脂血症的改善作用。实验设置正常饮食、高脂饮食及高脂饮食加口服 Wc1982 三组,共 18 个肝脏样本,提供原始基因水平计数和 FPKM 归一化表达值。数据可用于分析 PPARα 调控的脂肪酸摄取、氧化与生酮相关基因表达变化,以及经典和非经典 NF-κB 通路和纤维化相关基因的抑制情况,适合开展宿主代谢与转录调控研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 22 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究探讨了源自人类粪便的候选益生菌 Weissella confusa Wc1982 是否能改善 Golden Syrian 仓鼠中高脂饮食诱导的高脂血症,并表征了相关的肝脏转录反应。雄性 LVG 仓鼠接受正常饮食、高脂饮食或高脂饮食加口服 Wc1982(5 × 10^8 CFU/天)六周。肝脏 RNA 测序显示,Wc1982 增加了参与 PPARα 调控的脂肪酸摄取、脂肪酸氧化和生酮作用的基因表达,同时降低了经典和非经典 NF-κB 通路基因以及纤维化相关基因的表达。该数据集包含 18 个肝脏样本的原始基因水平计数和 FPKM 归一化表达值。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL28997、10036。本站分类:消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336151

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 30 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了源自人类粪便的候选益生菌魏斯氏菌Wc1982是否能改善高脂饮食诱导的金色叙利亚仓鼠高脂血症,并表征了相关的肝脏转录反应。雄性LVG仓鼠接受正常饮食、高脂饮食或高脂饮食加口服Wc1982(5×10^8 CFU/天)六周。肝脏RNA测序显示,Wc1982增加了参与PPARα调控的脂肪酸摄取、脂肪酸氧化和生酮作用的基因表达,同时降低了经典和非经典NF-κB通路基因以及纤维化相关基因的表达。该数据集包含18个肝脏样本的原始基因水平计数和FPKM归一化表达值。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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