河口海豚脑组织RNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE303874

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

气候变暖是加剧有害藻华（HABs）严重程度的因素之一。需要创新的暴露模型来理解有害藻华如何影响大脑健康。在此，我们研究了有害藻华暴露对搁浅于佛罗里达州印第安河潟湖的海豚大脑转录组的影响。我们报告，在藻华季节，神经毒素2,4-二氨基丁酸（2,4-DAB）在海豚大脑中的浓度比非藻华季节高2,900倍。同一批海豚显示出536个差异表达基因，其富集揭示出GABA能突触受损、基底膜改变以及随每个后续季节而增加的阿尔茨海默病（AD）风险因素。海豚还同时表现出类AD神经病理学改变以及随2,4-DAB暴露而升高的AD基因表达。我们的研究表明，不成比例的季节性2,4-DAB暴露会增加大脑转录组中的AD特征。随着气候变暖，有害藻华将继续加剧。理解有害藻华暴露的影响将有助于识别面临神经系统疾病风险的群体。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。