NCBI GEO 来源的 GSE27888 原始数据层
尽管其在阿尔茨海默病发病机制中起关键作用，淀粉样前体蛋白（APP）及其蛋白酶解片段的生理功能仍知之甚少。已证明分泌型 APPsα 的胞外域参与神经保护和突触可塑性
基本信息
资源简介
NCBI GEO 来源的 GSE27888 原始数据层
GSE27888 Raw Data Layer from NCBI GEO 是一个聚焦于神经系统疾病、特别是阿尔茨海默病研究的数据集，收录于 synapse.org。该数据集围绕淀粉样前体蛋白（APP）及其蛋白酶解片段的生理功能展开。尽管 APP 在阿尔茨海默病发病机制中扮演关键角色，但其生理功能至今仍未被充分理解。已有研究显示，分泌型 APPsα 的胞外域参与神经保护和突触可塑性调控。该数据集所对应的研究通过构建 APPsα 敲入小鼠与 APLP2 缺陷背景杂交得到的双突变模型，探索 APPsα 在体内的功能，尤其是其对 APP/APLP2 双敲除小鼠出生后致死性的挽救作用，为理解 APP 相关生理机制提供了原始数据层面的支持。
【数据集背景】
阿尔茨海默病是一种以认知功能衰退为特征的神经系统疾病，淀粉样前体蛋白（APP）的异常加工被认为在其发病机制中起关键作用。然而，APP 及其蛋白酶解片段在正常生理条件下的功能仍不明确。已有研究表明，由 α-分泌酶切割产生的分泌型 APPsα 胞外域具有神经保护作用，并参与突触可塑性的调节。另一方面，由 β-分泌酶和 γ-分泌酶切割产生的 APP 胞内结构域（AICD）在异源报告基因实验中表现出转录调节功能，但其对内源性基因调控的作用仍存在争议。为深入探究 APPsα 的生理功能，研究者此前已构建了仅表达分泌型胞外域 APPsα 的敲入（KI）小鼠。在此基础上，进一步将 APPsα-KI 小鼠与 APLP2 缺陷背景杂交，获得了双突变（APPsα-DM）小鼠，用以研究 APPsα 能否挽救 APP/APLP2 双敲除小鼠的出生后致死表型。该数据集即来源于这一研究背景下的原始数据层。
【数据内容】
该数据集为 GSE27888 的原始数据层，来源于 NCBI GEO 数据库，并通过 synapse.org 进行分发。其内容对应上述 APPsα 相关小鼠模型研究的原始数据。根据源站描述，研究涉及 APPsα-KI 小鼠、APLP2 缺陷背景以及 APPsα-DM 双突变小鼠。研究观察到，APPsα 能够挽救大多数 APP/APLP2 双敲除小鼠的出生后致死性。此外，尽管 APPsα-DM 小鼠的中枢神经系统形态正常，且基础突触传递未发生改变，但年轻 APPsα-DM 小鼠已经表现出某些异常（源站描述在此处中断，未提供完整结论）。该数据集的具体数据文件类型、样本数量、检测平台等信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 synapse.org，原始数据层对应 NCBI GEO 的 GSE27888。研究基于小鼠模型开展，涉及 APPsα 敲入小鼠、APLP2 缺陷小鼠以及二者杂交得到的双突变小鼠。源站描述提及了中枢神经系统形态评估和基础突触传递检测等实验内容，但具体的采集方法、实验条件、测序或检测平台、样本处理流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于神经科学领域，尤其是阿尔茨海默病相关的基础研究。具体而言，可用于探索 APP 及其蛋白酶解片段（如 APPsα）在神经保护、突触可塑性以及出生后存活中的生理功能。由于涉及 APPsα-KI 与 APLP2 缺陷背景的双突变模型，该数据也可能适用于研究 APP 家族蛋白之间的功能冗余与补偿机制。此外，对于关注 AICD 转录调控争议、APP 内源性基因调控等问题的研究者，该数据集可能提供原始数据层面的参考。但具体适用的分析类型和方法需结合数据实际内容判断，源站未提供明确的使用建议。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、预处理步骤、分析工具或流程等。用户如需使用，应参考 synapse.org 及 NCBI GEO 上 GSE27888 的官方说明。
【质量与限制】
该数据集为原始数据层，来源于 NCBI GEO，并通过 synapse.org 分发。源站描述中提及了部分实验观察结果，但未提供完整的研究结论。由于源站描述在关键处中断，关于年轻 APPsα-DM 小鼠的具体表型异常、数据完整性、样本量、技术重复、批次效应、数据质量控制指标等信息，源站未提供。因此，无法对该数据集的质量与局限性做出全面评估。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。用户在使用时应自行查阅 synapse.org 及 NCBI GEO 上 GSE27888 的相关页面，以获取准确的引用要求和许可条款。
下载信息
注册下载
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需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn178467
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
尽管在阿尔茨海默病发病机制中起着关键作用，但淀粉样前体蛋白（APP）及其蛋白水解片段的生理功能仍知之甚少。分泌型APPsα胞外域已被证明参与神经保护和突触可塑性。由β-分泌酶生成的APP胞内域（AICD）在异源报告基因实验中作为转录调节因子发挥作用，尽管其在内源性基因调控中的作用仍存在争议。此前，我们已构建了仅表达分泌型胞外域APPsα的APPsα敲入（KI）小鼠。在此，我们通过将APPsα-KI小鼠与APLP2缺陷背景杂交，构建了双突变体（APPsα-DM），并证明APPsα能够挽救大多数APP/APLP2双敲除小鼠的出生后致死性。尽管中枢神经系统形态正常且基础突触传递未改变，但年轻的APPsα-DM小鼠已表现出显著的海马功能障碍、空间学习受损以及LTP缺陷。
为了进一步从机制上了解哪些结构域/蛋白水解片段对海马APP/APLP2介导的功能至关重要，我们对成年APLP2-KO（APLP2-/-）和APPs?-DM小鼠（APP?/?APLP2-/-小鼠）的前额叶皮层和海马进行了DNA微阵列转录组分析。有趣的是，该分析未能揭示出与基因型相关的主要转录差异。然而，皮层与海马之间的表达差异却很容易检测到。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
