NCBI GEO 来源的 GSE25926 原始数据层
β-淀粉样前体蛋白 APP 及相关的 APLP 经历复杂的蛋白酶解加工，产生若干片段。尽管 Aβ 积累是阿尔茨海默病（AD）的核心触发因素已得到充分证实，但 APP 家族成员及其多种蛋白酶解产物的生理作用仍很大程度上未知
基本信息
资源简介
NCBI GEO 来源的 GSE25926 原始数据层
GSE25926 Raw Data Layer from NCBI GEO 是一个与神经系统疾病、特别是阿尔茨海默病相关的数据集，收录于 synapse.org。该数据集围绕 β-淀粉样前体蛋白 APP 及其相关 APLP 的复杂蛋白酶解加工过程展开。已知 Aβ 积累是阿尔茨海默病的重要触发因素，但 APP 家族成员及其多种蛋白酶解产物在生理条件下的作用仍不明确。分泌型 APPsα 胞外域被认为参与神经保护和突触可塑性，而由 β-分泌酶生成的 APP 胞内域 AICD 在异源报告基因实验中可作为转录调节因子，但其对内源基因调控的作用仍存在争议。该数据集用于进一步了解与敲除表型相关的分子变化，并阐明 APP 家族成员的生理功能及其可能的转录调控作用。
【数据集背景】
该数据集所属领域为神经系统疾病中的阿尔茨海默病。其研究背景涉及 β-淀粉样前体蛋白 APP 及相关 APLP 的蛋白酶解加工。APP 家族成员经过复杂切割后产生多种片段，其中 Aβ 的积累被认为是阿尔茨海默病的核心触发因素。与此同时，分泌型 APPsα 胞外域与神经保护和突触可塑性有关，β-分泌酶生成的 AICD 则可能在异源报告基因实验中发挥转录调节作用。然而，APP 家族成员及其多样蛋白酶解产物在生理状态下的功能仍很大程度上未知，AICD 对内源基因调控的作用也仍有争议。为深入理解敲除表型相关的分子变化，并阐明 APP 家族成员包括其被提出的转录调节作用在内的生理功能，相关研究采用了 DNA 微阵列分析。
【数据内容】
该数据集为 GSE25926 Raw Data Layer from NCBI GEO，属于原始数据层。其内容与 DNA 微阵列实验相关，用于研究与 APP 家族成员敲除表型相关的分子变化，并探索这些成员及其蛋白酶解产物在生理功能中的潜在作用。数据集分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。除上述信息外，源站未提供更具体的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源站为 synapse.org，英文名称为 GSE25926 Raw Data Layer from NCBI GEO。其名称表明该数据与 NCBI GEO 的 GSE25926 相关，并以原始数据层形式提供。除来源站和名称信息外，源站未提供关于样本采集、实验平台、组织类型、物种或处理条件的更多细节。
【适用场景】
该数据集适用于与阿尔茨海默病相关的神经系统疾病研究，尤其是围绕 β-淀粉样前体蛋白 APP、相关 APLP、其蛋白酶解加工产物以及敲除表型分子变化的研究场景。它可用于支持对 APP 家族成员生理功能的探索，包括分泌型 APPsα 胞外域与神经保护、突触可塑性之间关系的分析，以及 AICD 作为潜在转录调节因子的研究。由于涉及 DNA 微阵列分析，该数据集也可能适用于转录水平分子变化的探索。但具体适用场景需结合源站未提供的实验设计和样本信息进一步判断。
【使用方法】
源站未提供具体使用方法。该数据集以原始数据层形式存在，通常需要结合相应的数据处理流程、质量控制和分析工具进行使用。由于源站未提供平台信息、样本分组、预处理步骤或分析指南，无法进一步说明其具体使用方式。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、覆盖度、批次效应、样本量或验证情况的具体信息。已知限制包括：APP 家族成员及其蛋白酶解产物的生理作用仍很大程度上未知，AICD 对内源基因调控的作用仍存在争议。这些背景限制可能影响相关结论的解释。除上述内容外，源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
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需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn178569
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
β-淀粉样前体蛋白APP及其相关APLP经过复杂的蛋白水解加工，产生多种片段。尽管Aβ积累作为阿尔茨海默病(AD)的核心触发因素已得到充分证实，但APP家族成员及其多样蛋白水解产物的生理功能仍很大程度上未知。分泌型APPsα胞外域已被证明参与神经保护和突触可塑性。β-分泌酶生成的APP胞内域AICD在异源报告基因检测中作为转录调节因子发挥作用，尽管其在内源性基因调控中的作用仍存争议。为了进一步了解与敲除表型相关的分子变化，并阐明APP家族成员包括其作为转录调节因子所提出角色的生理功能，我们对成年野生型、APP-/-、APLP2-/-及APPsα敲入(KI)小鼠——后者仅表达分泌型APPsα胞外域——的额叶皮层进行了DNA微阵列转录组分析。
缺乏APP家族成员所影响的生物学通路包括神经发生调控、转录调控以及神经元投射发育调控。转录组变化的比较分析和qPCR验证确定了共调控基因集。有趣的是，这些基因集包括在敲除皮质中下调的热休克蛋白和可塑性相关基因。相比之下，我们未能检测到先前提出的AICD靶基因（包括Bace1、Kai1、Gsk3b、p53、Tip60和Vglut2）表达存在显著差异。仅在APLP2-/-小鼠中Egfr略有上调。APP-/-和APP?/?与野生型小鼠的比较揭示了高比例的共调控基因，表明C末端在细胞信号传导中具有重要作用。最后，对不同遗传背景下的APLP2-/-进行比较发现，背景相关的转录组变化可能主导
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
