GGA蛋白通过GAE结构域与BACE1相互作用改变APP加工数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.7qm89

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 57.6 MB。

数据说明

淀粉样前体蛋白(APP)经β-位点APP切割酶1(BACE1)的蛋白水解加工是产生β淀粉样蛋白(Aβ)的初始步骤，Aβ在阿尔茨海默病(AD)中于老年斑内积聚。这一切割过程的关键在于两种蛋白质通过内体/高尔基体区室的运输与分选。高尔基体定位的含γ-耳型ARF结合蛋白(GGA)在这些途径中具有显著的货物分选功能。近期研究表明，GGA1和GGA3能与BACE1相互作用，在神经元中表达，并在AD大脑中减少，而关于GGA2的了解甚少。鉴于GGA1通过将APP限制在高尔基体和核周区室来影响Aβ的生成，我们测试了所有GGA是否都能调节BACE1和APP的运输与加工。我们观察到，GGA过表达时，分泌型APPα(sAPPα)、sAPPβ和Aβ水平下降，而通过敲低可逆转这一现象。GGA与BACE1的共免疫沉淀在GGA-GAE结构域缺失时受损，但VHS结构域缺失则不影响。GGA1-VHS结构域的自身抑制对BACE1的相互作用无关紧要。我们的数据表明，所有三种GGA均通过GGA-GAE结构域影响APP的加工过程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。