阿尔茨海默病、路易体病及ALS-FTD谱系人中枢神经系统差异基因表达数据

该数据集来自 Mendeley Data,提供 60 个人中枢神经系统转录组数据集的差异表达分析结果及数据质量报告,覆盖阿尔茨海默病、路易体病以及肌萎缩侧索硬化与额颞叶痴呆谱系,共纳入 2,600 例患者与年龄匹配对照

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2021-01-14 更新
浏览 2
基因组分类神经系统疾病阿尔茨海默病路易体病ALS-FTD谱系差异基因表达转录组学ArrayExpress
Data from: Differential Gene Expression Data from the Human Central Nervous System across Alzheimer’s Disease, Lewy Body Diseases, and the Amyotrophic Lateral Sclerosis and Frontotemporal Dementia Spectrum

基本信息

模态
基因组
大小
0.68497767 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2021-01-14
版本
v2

资源简介

阿尔茨海默病、路易体病及ALS-FTD谱系人中枢神经系统差异基因表达数据

Differential Gene Expression Data from the Human Central Nervous System across Alzheimer’s Disease, Lewy Body Diseases, and the Amyotrophic Lateral Sclerosis and Frontotemporal Dementia Spectrum

该数据集来自 Mendeley Data,提供 60 个人中枢神经系统转录组数据集的差异表达分析结果及数据质量报告,覆盖阿尔茨海默病、路易体病以及肌萎缩侧索硬化与额颞叶痴呆谱系,共纳入 2,600 例患者与年龄匹配对照。数据可用于比较不同神经退行性蛋白病之间的基因表达变化,支持差异表达分析、跨疾病表达模式比较与候选标志物探索(来源 Mendeley Data)。

【数据集背景】

源站首次发布:2021-01-14。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在 Noori 等(2020)的研究中,我们假设阿尔茨海默病(AD)、路易体病(LBD)以及肌萎缩侧索硬化与额颞叶痴呆(ALS-FTD)谱系等神经退行性蛋白病存在共同的基因表达特征。为检验这一假设,我们对公共 Gene Expression Omnibus 和 ArrayExpress 存储库中的 60 个人中枢神经系统转录组数据集进行了系统综述与荟萃分析,共包含 2,600 例通过严格质量控制的 AD、LBD 和 ALS-FTD 患者及年龄匹配对照。在此,我们提供这 60 个数据集各自的差异表达分析结果及数据质量报告。这一涵盖 AD、LBD 和 ALS-FTD 的差异表达图谱可为未来阐明这些个体疾病的病理生理驱动因素的工作提供指导。

【数据结构与技术规格】

文件数 2136 个,合计 684.98 MB。数据集 DOI:10.17632/752nd4w7pd.2。

【主题与分类】

主题标签:神经系统疾病、阿尔茨海默病、路易体病、ALS-FTD谱系、差异基因表达、转录组学、ArrayExpress。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/752nd4w7pd

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 685.0 MB。

数据说明

Ayush Noori(2021)。阿尔茨海默病、路易体疾病以及肌萎缩侧索硬化与额颞叶痴呆谱系中人类中枢神经系统的差异基因表达数据[数据集]。http://doi.org/10.17632/752nd4w7pd.2

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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