夜间弱光对APP SAA敲入小鼠昼夜节律与阿尔茨海默病样病理影响的数据
该数据集来自 Dryad,对应一项关于夜间弱光(dLAN)暴露影响昼夜节律与阿尔茨海默病样病理的研究。实验使用携带野生型 APP(hAPP WT KI)或阿尔茨海默病相关 APP 突变(hAPP SAA KI)的人源化 APP 敲入小鼠,雌雄各半,12–13 月龄,分别置于标准 12:12 光暗周期

基本信息
资源简介
夜间弱光对APP SAA敲入小鼠昼夜节律与阿尔茨海默病样病理影响的数据
Data for: Dim light at night impacts circadian rhythms and Alzheimer’s disease-like pathology in APP SAA knock-in mice
该数据集来自 Dryad,对应一项关于夜间弱光(dLAN)暴露影响昼夜节律与阿尔茨海默病样病理的研究。实验使用携带野生型 APP(hAPP WT KI)或阿尔茨海默病相关 APP 突变(hAPP SAA KI)的人源化 APP 敲入小鼠,雌雄各半,12–13 月龄,分别置于标准 12:12 光暗周期或暗期被约 5 至 8 lux 弱光替代的周期中饲养 8 周。数据涵盖昼夜休息-活动节律(压电式活动记录,提取振幅、MESOR 等指标)、淀粉样蛋白β病理、胶质反应性与神经炎症,可用于研究环境光照对神经退行性病变的影响(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):夜间弱光(dLAN)日益被视为一种破坏昼夜节律并可能增加神经退行性疾病风险的环境因素。我们研究了长期 dLAN 暴露对携带野生型 APP(hAPP WT KI,JAX Stock #033013(RRID: IMSR_JAX:033013))或与阿尔茨海默病相关的 APP 突变(hAPP SAA KI,JAX Stock #034711(RRID: IMSR_JAX:034711))的人源化 APP 敲入小鼠的昼夜活动模式、淀粉样蛋白β(Abeta)病理、胶质反应性和神经炎症的影响。雌雄小鼠,12–13 月龄,在标准 12:12 光暗周期或暗期被约 5 至 8 lux 弱光替代的周期下饲养 8 周。使用压电式活动记录评估昼夜休息-活动节律,并提取多种指标,包括振幅、MESOR、
【主题与分类】
主题标签:Alzheimer's disease、Circadian、Sleep、Inflammation、Microglial cells。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.1g1jwsvb3
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5061/dryad.1g1jwsvb3
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 52.6 KB。
数据说明
夜间昏暗光线(dLAN)日益被认为是一种环境因素,可扰乱昼夜节律,并可能增加神经退行性疾病风险。我们研究了长期dLAN暴露对携带野生型APP(hAPP WT KI,JAX Stock #033013(RRID: IMSR_JAX:033013))或与阿尔茨海默病相关APP突变(hAPP SAA KI,JAX Stock #034711(RRID: IMSR_JAX:034711))的人源化APP敲入小鼠的昼夜活动模式、淀粉样蛋白β(Abeta)病理、胶质反应性和神经炎症的影响。12–13月龄的雄性和雌性小鼠在标准12:12明暗周期或暗期被约5至8勒克斯昏暗光线替代的周期下饲养8周。使用压电活动记录仪评估昼夜休息-活动节律,并在基线和第2、4、6、8周提取多项指标,包括振幅、MESOR、日间稳定性、日内变异性、明期和暗期活动计数以及明暗比。
通过免疫组织化学(6E10面积百分比和按大小分类的斑块计数)和ELISA(PBS、去垢剂和甲酸可溶性Abeta组分)评估脑内Abeta病理。使用GFAP、CD45和MHCII染色结合细胞大小分布定量星形胶质细胞和小胶质细胞反应,并在皮层和海马中测量炎症细胞因子和趋化因子(IL-1b、IL-6、TNFa、IL-10、IL-17A、CCL2、CCL3、CXCL1、CXCL2、CXCL10)。该数据集包含四个基因型-光照组的39只动物的个体水平数据,并提供全面的数据字典。这些数据可用于探索昼夜节律紊乱与阿尔茨海默样神经病理之间的相互作用,并为昼夜节律生物学和神经退行性变领域的重复研究、荟萃分析和整合研究提供资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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