CUIMC2多组学单核RNA/snATAC数据集
CUIMC2 多组学 snRNA/snATAC（CUIMC2_Mult）研究 哥伦比亚大学医学中心（CUIMC）的单核多组学队列由宗教秩序研究与记忆老化项目（ROSMAP）的 240 名参与者组成，ROSMAP 是一个老龄化与阿尔茨海默病的纵向临床-病理队列，参与者来自宗教秩序研究（ROS）（N=9
基本信息
资源简介
CUIMC2多组学单核RNA/snATAC数据集
CUIMC2_Mult（CUIMC2 多组学 snRNA/snATAC 研究）是哥伦比亚大学医学中心（CUIMC）建立的单核多组学队列数据集，收录于 synapse.org，在本站归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向。该队列由宗教秩序研究与记忆老化项目（ROSMAP）的 240 名参与者组成，ROSMAP 是面向老龄化与阿尔茨海默病的纵向临床-病理队列，其参与者来自宗教秩序研究（ROS，N=96）与记忆与老化项目（MAP，N=144）两项前瞻性研究。数据集以单核 RNA 与单核 ATAC 多组学数据为核心，配合队列层面的人口学与尸检时间信息，为研究阿尔茨海默病相关脑组织的转录调控与染色质可及性特征提供资源。
【数据集背景】
CUIMC2_Mult 依托哥伦比亚大学医学中心（CUIMC）的单核多组学队列建设。该队列的参与者全部来自 ROSMAP 这一老龄化与阿尔茨海默病纵向临床-病理队列，而 ROSMAP 本身由两项前瞻性研究构成：宗教秩序研究（ROS）纳入 96 人，记忆与老化项目（MAP）纳入 144 人，合计 240 名参与者。ROSMAP 的纵向临床-病理设计意味着参与者既有生前随访的临床信息，也有死后病理评估，这为在单核分辨率上开展多组学分析并与阿尔茨海默病表型关联提供了队列基础。
【数据内容】
数据集的核心内容是单核 RNA 与单核 ATAC 多组学数据（snRNA/snATAC），即在同一队列样本上同时获取转录组与染色质可及性信息。队列层面还包含参与者的人口学与尸检相关测量：全部参与者均为非西班牙裔白人，其中男性 89 人（占 38%），死亡年龄中位数为 89.79 岁（标准差 6.75），死后间隔中位数为 6.44 小时（标准差 5.21）。此外，阿尔茨海默病相关表型（如淀粉样蛋白、缠结、认知下降、APOE ε4 基因型测量）以及非阿尔茨海默病相关的神经学测量，可另行向 RADC Research Sharing Hub 申请获取。
【采集与来源】
数据来源于 synapse.org 上的 CUIMC2_Mult 研究页面。样本与临床-病理信息来自 ROSMAP 队列，该队列由 ROS 与 MAP 两项前瞻性研究组成，参与者为 240 名非西班牙裔白人。多组学数据为单核水平的 snRNA 与 snATAC 测量。关于具体的组织取材部位、测序平台、建库方法与数据处理流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于在单核分辨率上研究阿尔茨海默病及老龄化相关脑组织的转录组与染色质可及性特征，也适合将多组学测量与阿尔茨海默病相关表型（淀粉样蛋白、缠结、认知下降、APOE ε4 基因型）以及非阿尔茨海默病神经学测量进行关联分析。由于队列来自 ROSMAP 纵向临床-病理设计，还可用于结合尸检后间隔等队列层面变量开展分析。具体分析类型与已验证的应用方向，源站未提供。
【使用方法】
数据集托管于 synapse.org，可通过该平台获取。阿尔茨海默病相关表型与非阿尔茨海默病神经学测量需另行向 RADC Research Sharing Hub 申请。关于下载方式、文件格式、数据组织结构和分析工具的具体说明，源站未提供。
【质量与限制】
队列的人口学构成较为单一，全部参与者均为非西班牙裔白人，男性 89 人（38%），在推广到其他人群时需注意这一限制。死亡年龄中位数为 89.79 岁（标准差 6.75），死后间隔中位数为 6.44 小时（标准差 5.21），这些队列特征在解读多组学测量时需要考虑。关于数据质量评估、批次效应、样本排除标准等信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与使用许可条款，源站未提供。阿尔茨海默病相关表型及非阿尔茨海默病神经学测量需通过 RADC Research Sharing Hub 申请获取，相关数据共享条件以其规定为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn64769520
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
CUIMC2 多组学 snRNA/snATAC（CUIMC2_Mult）研究
哥伦比亚大学医学中心（CUIMC）的单核多组学队列由来自宗教修会研究与记忆衰老项目（ROSMAP）的240名参与者组成，ROSMAP是一个关于衰老与阿尔茨海默病的纵向临床-病理队列，其参与者来自宗教修会研究（ROS）（N=96）和记忆与衰老项目（MAP）（N=144）这两项前瞻性研究。所有参与者均为非西班牙裔白人，其中男性89名（38%），死亡时中位年龄为89.79岁（SD=6.75），死后中位间隔时间为6.44小时（SD=5.21）。阿尔茨海默病相关表型（如淀粉样蛋白、缠结、认知衰退及APOE ε4基因型测量）以及非AD相关神经学测量可另行向RADC研究共享中心（https://www.radc.rush.edu）申请获取。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
