人阿尔茨海默病脑组织冷冻电子断层扫描
EMPIAR-11920 人阿尔茨海默病脑组织的冷冻电子断层扫描 3.2 人阿尔茨海默病脑组织的倾斜系列 倾斜系列 MRC 3 1 SIGNED 16 BIT INTEGER 5760 4092 2.674 通过冷冻电子断层扫描与冷冻等离子体FIB揭示的尸检玻璃化人脑组织超微结构
基本信息
资源简介
人阿尔茨海默病脑组织冷冻电子断层扫描
该数据集为来源于 ebi.ac.uk 的 EMPIAR-11920，英文名称为 Cryo electron tomography of human Alzheimer's disease brain tissue，中文可译为“人阿尔茨海默病脑组织的冷冻电子断层扫描”。数据集归属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病分类，核心内容围绕人阿尔茨海默病脑组织的倾斜系列展开。源站描述表明，该数据涉及 3.2 倾斜系列，格式为 MRC，包含 3 个倾斜系列、1 个数据项，数据类型为 SIGNED 16 BIT INTEGER，图像尺寸为 5760 × 4092，像素尺寸为 2.674。相关研究主题为“通过冷冻电子断层扫描与冷冻等离子体 FIB 揭示的尸检玻璃化人脑组织超微结构”。整体而言，该数据集提供了用于观察人阿尔茨海默病脑组织超微结构的冷冻电子断层扫描倾斜系列数据。
【数据集背景】
该数据集面向神经系统疾病中的阿尔茨海默病研究，属于人阿尔茨海默病脑组织的冷冻电子断层扫描数据。源站描述中提及“通过冷冻电子断层扫描与冷冻等离子体 FIB 揭示的尸检玻璃化人脑组织超微结构”，说明其背景与利用冷冻电子断层扫描技术、结合冷冻等离子体聚焦离子束方法，对尸检来源并经过玻璃化处理的人脑组织进行超微结构观察有关。数据集分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病，表明其服务于该疾病相关的基础或病理研究。除上述信息外，源站未提供更详细的研究背景、项目目标或机构信息。
【数据内容】
数据内容为 EMPIAR-11920 人阿尔茨海默病脑组织的倾斜系列。源站描述显示，该数据包含 3.2 倾斜系列，具体为“人阿尔茨海默病脑组织的倾斜系列”。数据格式为 MRC，包含 3 个倾斜系列、1 个数据项，数据类型为 SIGNED 16 BIT INTEGER，图像尺寸为 5760 × 4092，像素尺寸为 2.674。这些信息共同描述了该数据集在冷冻电子断层扫描中所记录的倾斜系列图像的基本技术规格。除上述内容外，源站未提供关于样本数量、视野范围、倾斜角度范围、总剂量或其他成像参数的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk，标识为 EMPIAR-11920。源站描述中提及“尸检玻璃化人脑组织”，说明样本来源与尸检获得的人脑组织有关，并经过玻璃化处理；同时提及“冷冻电子断层扫描与冷冻等离子体 FIB”，表明采集过程涉及冷冻电子断层扫描以及冷冻等离子体聚焦离子束相关技术。数据以 MRC 格式记录倾斜系列，数据类型为 SIGNED 16 BIT INTEGER，图像尺寸为 5760 × 4092，像素尺寸为 2.674。除这些信息外，源站未提供具体的采集地点、采集时间、设备型号、操作人员或样本伦理审批等详细信息。
【适用场景】
该数据集适用于与人阿尔茨海默病脑组织超微结构相关的研究场景，尤其是利用冷冻电子断层扫描倾斜系列进行结构观察和分析的工作。由于数据分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病，并可支持对尸检玻璃化人脑组织的超微结构研究，因此可用于探索该疾病脑组织在纳米尺度上的结构特征。其 MRC 格式和 SIGNED 16 BIT INTEGER 数据类型适合在支持该格式的冷冻电子断层扫描数据处理环境中读取、重建和分析。除上述方向外，源站未提供关于具体应用案例、分析流程或预期结论的更多信息。
【使用方法】
该数据集以 MRC 格式提供倾斜系列数据，包含 3 个倾斜系列、1 个数据项，数据类型为 SIGNED 16 BIT INTEGER，图像尺寸为 5760 × 4092，像素尺寸为 2.674。使用者通常需要在支持 MRC 格式的冷冻电子断层扫描数据处理软件中导入这些倾斜系列，进而开展后续处理。源站未提供具体的处理步骤、推荐软件、参数设置、重建流程或分析指南，因此相关使用方法需依据通用冷冻电子断层扫描数据处理实践进行，但源站未给出针对该数据集的具体操作说明。
【质量与限制】
源站描述提供了该数据集的基本技术规格，包括 3.2 倾斜系列、MRC 格式、3 个倾斜系列、1 个数据项、SIGNED 16 BIT INTEGER 数据类型、5760 × 4092 图像尺寸以及 2.674 像素尺寸。这些信息可用于判断数据的基本组织形式和图像维度。然而，源站未提供关于数据质量评估、信噪比、缺失情况、倾斜角度完整性、对齐精度或重建效果的具体指标。因此，该数据集在质量与限制方面的进一步信息源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk，标识为 EMPIAR-11920。源站描述中未提供具体的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求。因此，关于引用方式与许可条件的信息源站未提供。使用者在利用该数据集时，应自行查阅来源站点的相关说明以确认引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-11920
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMPIAR-11920 人阿尔茨海默病脑组织的冷冻电子断层扫描 3.2 人阿尔茨海默病脑组织的倾斜系列 倾斜系列 MRC 3 1 有符号16位整数 5760 4092 2.674 通过冷冻电子断层扫描与冷冻等离子体聚焦离子束揭示的尸检玻璃化人脑组织超微结构
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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