散发性阿尔茨海默病脑tau蛋白丝冷冻电镜数据

EMPIAR-10230 散发性阿尔茨海默病脑tau蛋白丝的冷冻电镜 27.0 散发性阿尔茨海默病脑(病例2)tau蛋白丝的剂量加权微图 微图 - 单帧 MRC 507 1 32 BIT FLOAT PHF和SF的丝状结构起点和终点

biostudies
浏览 10
蛋白质图像分割阿尔茨海默病tau蛋白丝冷冻电镜神经系统疾病EMPIAR-10230PHFSF
Cryo electron microscopy of tau filaments from sporadic Alzheimer's disease brain

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

散发性阿尔茨海默病脑tau蛋白丝冷冻电镜数据

该数据集为散发性阿尔茨海默病脑组织中tau蛋白丝的冷冻电镜数据,英文名称为“Cryo electron microscopy of tau filaments from sporadic Alzheimer's disease brain”,在来源站点的编号为EMPIAR-10230。数据集归属于神经系统疾病下的阿尔茨海默病分类,来源站为ebi.ac.uk。其核心内容围绕散发性阿尔茨海默病脑(病例2)中tau蛋白丝的剂量加权微图展开,包含单帧MRC格式的微图数据,以及PHF(成对螺旋丝)和SF(直丝)的丝状结构起点和终点信息。这些数据可用于观察和分析tau蛋白丝在散发性阿尔茨海默病中的冷冻电镜结构特征。

【数据集背景】

该数据集聚焦于散发性阿尔茨海默病(sporadic Alzheimer's disease)脑组织中的tau蛋白丝。阿尔茨海默病是一种常见的神经系统疾病,tau蛋白异常聚集形成的丝状结构是其重要的病理特征之一。本数据集通过冷冻电镜技术获取散发性阿尔茨海默病脑(病例2)中tau蛋白丝的图像数据,旨在为相关结构研究提供原始微图及丝状结构定位信息。来源站点为ebi.ac.uk,数据集在该站点的标识为EMPIAR-10230。

【数据内容】

数据集包含散发性阿尔茨海默病脑(病例2)tau蛋白丝的剂量加权微图(dose-weighted micrographs)。具体数据形式为微图,单帧,格式为MRC,数据类型为32 BIT FLOAT。数据量为507。此外,数据集还包含PHF(成对螺旋丝)和SF(直丝)的丝状结构起点和终点信息。这些内容共同构成了对tau蛋白丝冷冻电镜观察的基础数据集合。

【采集与来源】

数据来源于ebi.ac.uk站点,标识为EMPIAR-10230。样本为散发性阿尔茨海默病脑组织,具体为病例2。采集方式为冷冻电镜(cryo electron microscopy),产出的微图为剂量加权形式。关于采集设备、采集参数、样本制备方法、采集时间等更详细的采集信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于对散发性阿尔茨海默病中tau蛋白丝结构进行观察和分析的研究场景。具体而言,可利用剂量加权微图进行tau蛋白丝的形态学观察,借助PHF和SF的起点和终点信息定位丝状结构,支持冷冻电镜图像处理、结构解析或相关病理特征研究。由于数据涉及散发性阿尔茨海默病脑组织,也可用于与该疾病相关的神经系统疾病研究。其他具体适用场景,源站未提供。

【使用方法】

数据集以MRC格式提供单帧32 BIT FLOAT微图,共507个。使用者可按照冷冻电镜微图的常规处理流程读取这些MRC文件,并结合PHF和SF的起点和终点信息对tau蛋白丝进行定位与分析。关于具体的软件工具、处理参数、分析流程等,源站未提供。

【质量与限制】

数据集为剂量加权微图,单帧,MRC格式,32 BIT FLOAT,数量为507。数据来自散发性阿尔茨海默病脑病例2。关于数据的分辨率、信噪比、完整性、批次差异、潜在偏差等质量指标与限制条件,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于ebi.ac.uk,标识为EMPIAR-10230。关于具体的引用要求、许可协议、使用条款等信息,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-10230

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

EMPIAR-10230 散发性阿尔茨海默病脑组织中tau蛋白丝的冷冻电镜图像 27.0 散发性阿尔茨海默病脑组织(病例2)中tau蛋白丝的剂量加权显微图像 - 单帧MRC 507 1 32位浮点 用于PHFs和SFs的丝状体起点和终点

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案