cEpiReg

cEpiReg是一个整合单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序数据的多模态生物医学数据集,包含顺式调控元件、转录因子与目标基因的调控网络信息,主要用于研究阿尔茨海默病的遗传学调控机制,揭示疾病发病过程中的隐藏调控链接,为疾病机制解析和靶点发现提供数据支持。

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2024-05-17 更新
阿尔茨海默病遗传学
创建时间2024-05-16
更新时间2024-05-17
原始链接

https://github.com/jawa23bio/cEpiReg

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资源简介

cEpiReg是一个综合数据库,旨在阐明阿尔茨海默病(AD)遗传学中复杂的基因调控机制。该数据集通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞染色质可及性测序(sc-ATAC-seq)数据,识别顺式调控元件(CREs),并与ENCODE、Epimap、GWAS Catalog等公共数据库进行比较。项目构建了一个连接转录因子(TFs)、CREs和目标基因的调控网络框架,揭示了AD发病机制中潜在的隐藏调控链接,为理解AD的遗传基础和寻找治疗靶点提供资源。

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