阿尔茨海默病动物模型中神经精神障碍相关基因的大数据分析

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A3d271688cfd808228ef2a2705023a3c75788aa0ac4bbeb046a3038a4595a8d1c

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病是一种以认知功能受损和记忆丧失为特征的神经退行性疾病，影响全球数百万个体。随着阿尔茨海默病患病率的急剧上升，预计将带来沉重的公共卫生和经济负担。然而，这一负担对阿尔茨海默病患者的照护者尤为沉重，会引发神经精神症状，包括情绪波动、幻觉和抑郁。有趣的是，这些神经精神症状与双相情感障碍、精神分裂症和重度抑郁症的症状有共同之处。尽管症状学上存在相似性，但在阿尔茨海默病模型中，阿尔茨海默病与这些神经精神障碍的共病情况尚未被研究。在此，我们通过阿尔茨海默病动物模型——前脑特异性PSEN双敲除小鼠的微阵列，探索与双相情感障碍、精神分裂症和重度抑郁症相关基因的基因表达的综合变化。

为在我们的微阵列数据范围内分析与这三种神经精神疾病相关的基因，我们从总计45，037个基因中筛选出符合选择标准的1207个基因。这些基因是基于与这三种疾病显著相关的14个基因本体论术语而选出的，这些术语由精神病基因组学联盟先前开展的研究确定。我们的研究表明，前脑特异性缺失阿尔茨海默病基因可显著改变神经精神疾病相关基因。最重要的是，这些显著改变的基因大多与精神分裂症有关。综上所述，我们认为阿尔茨海默病基因突变导致的突触功能障碍不仅可导致记忆丧失和认知损害的表现，还可导致神经精神症状。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。