Ephexin5 通过活动依赖性调控 Cdc42 驱动突触生长与稳定
该数据集来自 search.dataone.org,归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,主题涉及突触可塑性、RhoGEF、Ephexin5、树突棘、双光子成像与 Cdc42

基本信息
资源简介
Ephexin5 通过活动依赖性调控 Cdc42 驱动突触生长与稳定
Activity-dependent regulation of Cdc42 by Ephexin5 drives synapse growth and stabilization
该数据集来自 search.dataone.org,归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,主题涉及突触可塑性、RhoGEF、Ephexin5、树突棘、双光子成像与 Cdc42。源站描述显示,研究聚焦于 Ephexin5 这一与阿尔茨海默病及 Angelman 综合征相关的 RhoGEF,探讨其在脑内同时激活 RhoA 与 Cdc42,并借助 GTPase 生物传感器活体成像揭示其在单个突触处活动依赖性调控 Cdc42 而非 RhoA 信号,且该选择性受酪氨酸磷酸化与神经元活动调控。数据可用于突触生长与稳定机制、神经疾病相关信号通路研究(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):突触 RhoGEF 在调控对学习至关重要的活动依赖性神经元可塑性中发挥关键作用。Ephexin5 是一种与阿尔茨海默病和 Angelman 综合征病因相关的 RhoGEF,最初在神经元中被报道为一种 RhoA 特异性 GEF,负向调控树突棘突触密度。在此,我们表明 Ephexin5 在脑内同时激活 RhoA 和 Cdc42。此外,利用 GTPase 生物传感器的活体成像,我们证明 Ephexin5 在单个突触处调控活动依赖性 Cdc42 而非 RhoA 信号。Ephexin5 对 Cdc42 激活的选择性受酪氨酸磷酸化调控,而酪氨酸磷酸化受神经元活动调控。最后,与 Ephexin5 负向调控突触密度的作用相反,我们表明在神经元活动下游,Ephexin5 正向调控突触生长与稳定。我们的结果支持一个模型 i
【主题与分类】
主题标签:Synaptic plasticity、RhoGEF、Ephexin5、Dendritic spine、two-photon imaging、cdc42。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae97ac94e826f12288a522b0e772bdcea3649e307376082ab12fbcf92eb4f792e
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
突触RhoGEF在调控对学习至关重要的活动依赖性神经元可塑性中发挥关键作用。Ephexin5是一种与阿尔茨海默病和Angelman综合征病因学相关的RhoGEF,最初在神经元中被报道为一种RhoA特异性GEF,负向调控树突棘突触密度。在此,我们证明Ephexin5在大脑中同时激活RhoA和Cdc42。此外,利用GTP酶生物传感器的活细胞成像,我们证明Ephexin5在单个突触处调控活动依赖性Cdc42信号,而非RhoA信号。Ephexin5对Cdc42激活的选择性受酪氨酸磷酸化调控,而酪氨酸磷酸化又受神经元活动调控。最后,与Ephexin5负向调控突触密度的作用相反,我们证明在神经元活动下游,Ephexin5正向调控突触生长和稳定。
我们的结果支持一个模型,其中诱导可塑性的神经元活动调节Ephexin5酪氨酸磷酸化,驱动Ephexi…,,,# 数据来源:Ephexin5对Cdc42的活动依赖性调节驱动突触生长与稳定 在Dryad上访问数据集 # 概述 本数据集包含4种类型的数据:双光子成像(2-photon)荧光数据、福斯特共振能量转移-荧光寿命成像显微镜(FRET-FLIM)数据、Western印迹数据和免疫组织化学(IHC)荧光数据。双光子荧光数据是使用定制的双光子显微镜收集的。绿色荧光在通道1中获取,红色荧光在通道2中获取。分析使用定制的MATLAB软件进行。FRET-FLIM数据是使用定制的双光子显微镜结合时间相关单光子计数收集的。寿命数据存储在通道1中,红色细胞填充的荧光强度存储在通道2中。数据使用定制的MATLAB软件进行分析。IHC荧光数据是使用Zeiss Apotome 3结构
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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