生理性朊病毒聚集连续模型数据:Orb2 与长期突触信息门控

该数据集来自 Dryad,对应一项关于生理性朊病毒聚集连续模型的研究,聚焦果蝇 Orb2A 与 Orb2B 的聚集行为。Orb2 是 CPEB 蛋白家族成员,与长期记忆及突触可塑性相关,其两种主要异构体可形成活性诱导的淀粉样功能性聚集体,被视为 RNA 结合蛋白的翻译诱导状态

DryadDryad
dryad
浏览 18
基因组预测Long term memoryamyloidOrb2physiological prionSynaptic plasticity
Data from: A continuous model of physiological prion aggregation suggests a role for Orb2 in gating long-term synaptic information

基本信息

模态
基因组
大小
0.000823085 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

生理性朊病毒聚集连续模型数据:Orb2 与长期突触信息门控

Data from: A continuous model of physiological prion aggregation suggests a role for Orb2 in gating long-term synaptic information

该数据集来自 Dryad,对应一项关于生理性朊病毒聚集连续模型的研究,聚焦果蝇 Orb2A 与 Orb2B 的聚集行为。Orb2 是 CPEB 蛋白家族成员,与长期记忆及突触可塑性相关,其两种主要异构体可形成活性诱导的淀粉样功能性聚集体,被视为 RNA 结合蛋白的翻译诱导状态。数据可用于构建和检验双状态连续微分模型,为研究朊病毒样 CPEB 蛋白在长期突触信息门控中的作用提供假设与建模基础(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2018。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):突触层面的 mRNA 翻译调控被认为在细胞层面的记忆与学习中具有基础性作用。细胞质多聚腺苷酸化元件结合(CPEB)蛋白家族在发育过程中和成年神经元中作为重要的 RNA 结合蛋白家族出现。果蝇 Orb2(小鼠 CPEB3 蛋白和海兔 CPEB 神经同源物的同源物)已被发现参与可塑性依赖 mRNA 的翻译,并与长期记忆相关。Orb2 蛋白呈现两种主要异构体,Orb2A 和 Orb2B,它们形成一种活性诱导的淀粉样功能性聚集体,该聚集体被认为是 RNA 结合蛋白的翻译诱导状态。在此,我们提出了首个针对 Orb2A-Orb2B 聚集的双状态连续微分模型。该模型为研究朊病毒样 CPEB 蛋白的作用提供了新的工作假设。

【主题与分类】

主题标签:Long term memory、amyloid、Orb2、physiological prion、Synaptic plasticity。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.h2372g0

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.h2372g0

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 823.1 KB。

数据说明

突触层面的mRNA翻译调控被认为是在细胞层面记忆和学习的基础。细胞质多聚腺苷酸化元件结合蛋白(CPEB)家族在发育过程中及成年神经元中作为重要的RNA结合蛋白家族崭露头角。果蝇Orb2(小鼠CPEB3蛋白和海兔CPEB神经异构体的同源物)已被发现参与可塑性相关mRNA的翻译,并与长期记忆相关联。Orb2蛋白主要有两种异构体,Orb2A和Orb2B,它们形成一种活动诱导的淀粉样功能性聚集体,这被认为是RNA结合蛋白的翻译诱导状态。在此,我们提出了首个关于Orb2A-Orb2B聚集的双态连续微分模型。该模型为研究类朊病毒CPEB蛋白在长期突触可塑性中的作用提供了新的工作假设。此外,该模型可作为第一步,用于将翻译和蛋白质聚集依赖的现象整合到突触易化规则中。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案