小鼠初级视觉皮层恐惧记忆获取与提取期间单神经元分辨率cAMP动态数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.nb.00039

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

概述我们提供了一个小鼠初级视觉皮层（V1）在为期3天的恐惧条件化范式期间获取的体内时空神经元cAMP双光子荧光信号数据集。在三天记录期内共稳定追踪了1，844个神经元，其中光线索恐惧条件化组（n = 25只小鼠）包含1，023个神经元，场景恐惧条件化组（n = 16只小鼠）包含821个神经元。该数据集包括原始和校正后的荧光图像、Suite2p和Track2p处理输出、整理后的单神经元活动轨迹、同步行为视频和僵直行为评分、事件时间戳文件，以及全面的元数据和Python分析工作流程。任务摘要实验组1（光线索恐惧条件化）——第1天（前测试）：将小鼠置于恐惧条件化场景A中。在此期间，给予四次非强化蓝光刺激（每次5秒），刺激间隔为90秒。第2天（训练）：将小鼠放回场景A，并接受四次蓝光刺激（每次5秒）。

这些操作伴随1秒足部电击（1 mA），电击与每次光刺激的最后1秒同时发生。第3天（测试）：将小鼠置于具有不同视觉和触觉刺激的新环境B中，接受四次非强化蓝光刺激（每次5秒）。实验组2（情境恐惧条件化）——第1天（训练）：小鼠在环境A中接受四次足部电击（每次1秒，0.75 mA），刺激间隔为90秒，无光-电击配对。第2天（测试1）：将小鼠重新暴露于环境A，期间不施加电击刺激。第3天（测试2）：将小鼠暴露于无足部电击刺激的新环境B。数据预处理与神经元识别原始双光子荧光图像（TIFF格式）通过多步骤流程处理：原始显微镜数据 → 平均投影质量控制 → SuperNerve运动校正

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。