统一化死后神经退行性疾病脑与脊髓转录组汇编(ALS、FTD谱系、阿尔茨海默病及其他)
该数据集为统一化死后神经退行性疾病脑与脊髓转录组汇编,覆盖ALS、FTD谱系、阿尔茨海默病及其他疾病,基于GEO与ArrayExpress开放数据构建

基本信息
资源简介
统一化死后神经退行性疾病脑与脊髓转录组汇编(ALS、FTD谱系、阿尔茨海默病及其他)
A harmonized post-mortem neurodegeneration brain and spinal cord transcriptome compendium (ALS, FTD spectrum, Alzheimer's disease and others)
该数据集为统一化死后神经退行性疾病脑与脊髓转录组汇编,覆盖ALS、FTD谱系、阿尔茨海默病及其他疾病,基于GEO与ArrayExpress开放数据构建。共1847个样本通过QC,来自4个源登录号(E-MTAB-2325、E-MTAB-8635、GSE153960、GSE26927)。数据包含逐系列基因表与QC、ComBat前后合并矩阵、样本注释表、批次诊断、逐系列效应量、DerSimonian-Laird荟萃分析及留一系列AUC,可用于跨疾病转录组比较与生物标志物探索(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):统一化死后神经退行性疾病脑与脊髓转录组汇编(ALS、FTD谱系、阿尔茨海默病及其他)。于2026-10-20基于开放GEO和ArrayExpress数据构建,采用与跨疾病血液干扰素资源(Zenodo记录23427859)相同的流程:逐系列基因表与QC、按隔室ComBat前后的合并矩阵、一个样本注释表、批次诊断、逐系列效应量、DerSimonian-Laird荟萃分析和留一系列AUC。1847个样本通过QC,来自4个源登录号(E-MTAB-2325、E-MTAB-8635、GSE153960、GSE26927)。所有排除和方法偏差列于EXCLUSIONS_AND_DEVIATIONS.md。
【主题与分类】
主题标签:amyotrophic lateral sclerosis、frontotemporal dementia、Alzheimer's disease、post-mortem brain、spinal cord、transcriptome、ComBat、microglia、interferon。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23498186
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.23498186
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 221.2 MB。
数据说明
一个协调统一的死后神经退行性疾病脑与脊髓转录组汇编(涵盖ALS、FTD谱系、阿尔茨海默病及其他疾病)。于2026-10-20基于公开的GEO和ArrayExpress数据构建,采用与跨疾病血液干扰素资源(Zenodo记录23427859)相同的流程:各系列基因表与质量控制、按隔室在ComBat校正前后的合并矩阵、单一样本注释表、批次诊断、各系列效应量、DerSimonian-Laird荟萃分析以及留一系列法AUC。来自4个源登录号(E-MTAB-2325、E-MTAB-8635、GSE153960、GSE26927)的1847个样本通过质量控制。所有排除项和方法偏差均列于EXCLUSIONS_AND_DEVIATIONS.md中。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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