TARGET肾脏肾母细胞瘤dbGaP研究

资源简介

TARGET肾脏肾母细胞瘤dbGaP研究

【一句话概览】

TARGET 肾母细胞瘤（WT）数据集包含 130 例经充分表征的高危肾母细胞瘤患者病例，均为肿瘤/正常配对，其中 8 例附有额外样本用于分析，包括 3 例肿瘤邻近正常样本和 5 例复发样本。每例均具备基因表达、肿瘤与配对正常样本拷贝数分析、甲基化及全基因组测序数据，部分病例还提供 mRNA-seq、miRNA-seq 和全外显子测序数据。所有病例可通过 TARGET 数据矩阵中的病例矩阵按数据类型排序。受试者数为 653（来源 NCBI）。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《TARGET: Kidney, Wilms Tumor (WT)》。

【数据内容】

源站原始描述：There are 130 fully characterized patient cases with high risk Wilms tumor (all tumor/normal pairs; 8 with additional samples for analysis = 3 with tumor adjacent normal, 5 with relapse sample) that will make up the TARGET WT dataset. Each case will have gene expression, tumor and paired normal copy number analyses, methylation and whole genome sequencing; a subset of WT cases with mRNA-seq, miRNA-seq, and whole exome sequencing data available as well. All cases can be sorted according to data t…

中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：TARGET WT数据集将由130个完全特征明确的高风险Wilms瘤患者病例组成（所有均为肿瘤/正常配对；其中8例有额外样本可供分析，包括3例肿瘤邻近正常组织，5例复发样本）。每个病例都将进行基因表达、肿瘤及配对正常组织的拷贝数分析、甲基化及全基因组测序；一部分WT病例还提供了mRNA-seq、miRNA-seq和全外显子测序数据。所有病例均可通过TARGET数据矩阵上的病例矩阵按数据类型进行排序。欲了解此项目及其他TARGET基因组学项目的更多信息，请访问TARGET网站：http://ocg.cancer.gov/programs/target 。有关任何TARGET子研究数据共享的最新详情，请参阅OCG网站上的TARGET出版指南。

【主题与分类】

主题标签：Wilms Tumor、Kidney Cancer、Pediatric Cancer、TARGET、dbGaP、gene expression、copy number、methylation、whole genome sequencing、mRNA-seq。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000471.v18.p7