人类扁桃体基质细胞与免疫细胞单细胞RNA测序数据集

Name: 人类扁桃体基质细胞与免疫细胞单细胞RNA测序数据集
Creator: Ludewig Lab
License: CC BY 4.0

该数据集提供了来自9名患者20份人类扁桃体样本的单细胞RNA测序数据，包含基质细胞、T细胞和B细胞等多种细胞类型的基因表达谱，主要应用于研究扁桃体微环境中基质细胞与免疫细胞的相互作用、细胞异质性以及相关免疫调控机制，为扁桃体炎、扁桃体癌等疾病的分子基础研究提供重要资源。

Ludewig Lab

Figshare

2023-03-30 更新

single cell transcriptomicsfibroblastic reticular cellstonsilsImmunology

Human Tonsillar Stromal Cells and Immune Cells Single-Cell RNA Sequencing Dataset

基本信息

大小

1.15 GB

许可

CC BY 4.0

创建/更新时间

2023-03-30

版本

资源简介

人类扁桃体基质细胞与免疫细胞单细胞RNA测序数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Human tonsillar stromal cells and immune cells》。源站首次发布：2023-03-30。

【数据内容】

源站原始描述：Hematopoietic cells were stained with fluorochrome-conjugated antibodies against human CD45, CD3, CD19 and CD14 and stromal cells with fluorochrome-conjugated antibodies against human CD45 and CD235a. Live/dead cell discrimination was performed by adding 7-amino-actinomycin D (7AAD; Calbiochem) prior to acquisition. CD45– CD235a– stromal cells, CD45+ CD3+ T cells and CD45+ CD19+ B cells were sorted with a BD FACS Melody cell sorter (BD Biosciences) and run on the 10x Chromium analyzer (10X Genom…

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个，合计 1.15 GB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.21325737.v1。

【主题与分类】

源站学科分类：Immunology not elsewhere classified。主题标签：single cell transcriptomics、fibroblastic reticular cells、tonsils、Immunology。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Immunology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Human_tonsillar_stromal_cells_and_immune_cells/21325737

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Ludewig Lab; De Martin, Angelina (2023). Human tonsillar stromal cells and immune cells. figshare. Dataset

原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/Human_tonsillar_stromal_cells_and_immune_cells/21325737/1

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取（Figshare）

源站：https://figshare.com/articles/dataset/Human_tonsillar_stromal_cells_and_immune_cells/21325737/1

按页面 Download 按钮获取。

数据说明

该数据集包含来自9名患者共20份人类扁桃体样本的单细胞RNA测序数据。研究团队通过流式细胞分选技术分离了CD45– CD235a–基质细胞、CD45+ CD3+ T细胞和CD45+ CD19+ B细胞，使用10x Chromium平台进行单细胞测序。数据经过CellRanger处理和质量控制，利用Seurat软件进行标准化、降维、聚类和差异表达分析。数据集特别关注扁桃体基质细胞（包括成纤维网状细胞FRC）的异质性及其与免疫细胞的相互作用，为研究扁桃体微环境、免疫调控机制以及相关疾病（如扁桃体炎、扁桃体癌）提供了高分辨率的分子图谱。