人类扁桃体基质细胞与免疫细胞单细胞RNA测序数据集
该数据集提供了来自9名患者20份人类扁桃体样本的单细胞RNA测序数据，包含基质细胞、T细胞和B细胞等多种细胞类型的基因表达谱，主要应用于研究扁桃体微环境中基质细胞与免疫细胞的相互作用、细胞异质性以及相关免疫调控机制，为扁桃体炎、扁桃体癌等疾病的分子基础研究提供重要资源。
创建时间2023-03-30
更新时间2023-03-30
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Human_tonsillar_stromal_cells_and_immune_cells/21325737/1
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资源简介
该数据集包含来自9名患者共20份人类扁桃体样本的单细胞RNA测序数据。研究团队通过流式细胞分选技术分离了CD45– CD235a–基质细胞、CD45+ CD3+ T细胞和CD45+ CD19+ B细胞，使用10x Chromium平台进行单细胞测序。数据经过CellRanger处理和质量控制，利用Seurat软件进行标准化、降维、聚类和差异表达分析。数据集特别关注扁桃体基质细胞（包括成纤维网状细胞FRC）的异质性及其与免疫细胞的相互作用，为研究扁桃体微环境、免疫调控机制以及相关疾病（如扁桃体炎、扁桃体癌）提供了高分辨率的分子图谱。
提供机构：Lütge, Mechthild; De Martin, Angelina
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