多队列机器学习和实验验证识别THY1作为胃癌细胞外基质重塑相关生物标志物的支持数据
该数据集为一项多队列机器学习与实验验证研究的支持数据，研究识别THY1作为胃癌细胞外基质重塑相关生物标志物。数据覆盖Figure 7和Figure 8的源数值数据、Supplementary Tables S1-S7、未裁剪的western blot图像，以及用于公共数据集预处理、机器学习分析、统计
基本信息
资源简介
多队列机器学习和实验验证识别THY1作为胃癌细胞外基质重塑相关生物标志物的支持数据
Supporting data for “Multi-cohort machine learning and experimental validation identify THY1 as an extracellular matrix remodeling-associated biomarker in gastric cancer”
该数据集为一项多队列机器学习与实验验证研究的支持数据，研究识别THY1作为胃癌细胞外基质重塑相关生物标志物。数据覆盖Figure 7和Figure 8的源数值数据、Supplementary Tables S1-S7、未裁剪的western blot图像，以及用于公共数据集预处理、机器学习分析、统计分析和可视化的分析代码。研究使用GEO、TCGA-STAD和TISCH2的公共转录组数据，其中GSE118916、GSE54129、GSE63089和GSE65801作为训练/发现队列，GSE146996、GSE51575和GSE66229用于外部验证，TCGA-STAD用于生存和临床病理分析（来源 figshare，CC BY 4.0 。
【数据集背景】
项目资助方：Natural Science Foundation of Jilin Province (YDZJ202601ZYTS412). Department of Finance of Jilin Province (2025WSZX-Jc04).。源站首次发布：2026-10-20。
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 13.62 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.34715742.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Signal transduction、Cell development, proliferation and death。主题标签：Gastric Cancer BackgroundIn、CD90/Thy1。本站分类：肿瘤/胃癌。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Signal transduction、Cell development, proliferation and death。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Supporting_data_for_Multi-cohort_machine_learning_and_experimental_validation_identify_THY1_as_an_extracellular_matrix_remodeling-associated_biomarker_in_gastric_cancer_/34715742
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Zhipeng, Zhao; Li, Rudong; Liu, Tong; Wang, Siyi; Sun, Xin; Wu, Xuhui; et al. (2026). Supporting data for “Multi-cohort machine learning and experimental validation identify THY1 as an extracellular matrix remodeling-associated biomarker in gastric cancer”. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.34715742.v1
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 13.6 MB。
数据说明
本数据集包含题为“多队列机器学习与实验验证确定THY1作为胃癌细胞外基质重塑相关生物标志物”研究的支持数据和分析材料。存放的材料包括：(1) 图7和图8中实验分析所依据的源数值数据；(2) 补充表S1-S7；(3) 未裁剪的蛋白质印迹图像；(4) 用于公共数据集预处理、机器学习分析、统计分析和可视化的分析代码。本研究分析的公共转录组数据集来自GEO、TCGA-STAD和TISCH2。GEO数据集GSE118916、GSE54129、GSE63089和GSE65801用作训练/发现队列；GSE146996、GSE51575和GSE66229用于外部验证；TCGA-STAD用于生存和临床病理分析；GSE134520和GSE167297用于单细胞转录组背景分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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