胃癌代谢生物标志物
该数据集来源于omicsdi.org,聚焦胃癌代谢生物标志物研究。数据基于血浆样本的UPLC-MS/MS非靶向代谢组学分析,共纳入144名参与者,通过PLS-DA三维得分图区分胃癌患者与非胃癌对照,并经过代谢谱分析与差异比较,鉴定出93个胃癌患者与健康对照之间的候选差异血液代谢物

基本信息
资源简介
胃癌代谢生物标志物
该数据集聚焦于胃癌代谢生物标志物研究,来源于omicsdi.org,归类于肿瘤/胃癌方向,主题标签为代谢组学。研究以血浆样本为分析对象,采用UPLC-MS/MS非靶向代谢组学技术开展检测,共纳入144名参与者。通过偏最小二乘判别分析(PLS-DA)三维得分图,对胃癌患者与非胃癌对照进行区分;在此基础上开展代谢谱分析与差异比较,鉴定出93个胃癌患者与健康对照之间的候选差异血液代谢物。该数据集可为胃癌代谢层面的生物标志物发现、代谢通路探索以及胃癌与健康状态的判别分析提供数据基础,适用于代谢组学、肿瘤标志物筛选及相关转化研究等场景。
【数据集背景】
胃癌是肿瘤研究领域的重要方向之一,寻找可用于区分胃癌患者与非胃癌人群的血液代谢标志物,是代谢组学在肿瘤研究中常见的应用方向。该数据集以胃癌代谢生物标志物为主题,来源于omicsdi.org,本站分类为肿瘤/胃癌,主题标签为代谢组学。其研究目标围绕胃癌患者与健康对照之间的代谢差异展开,试图通过血浆代谢谱分析获得候选差异血液代谢物,从而为胃癌相关代谢标志物研究提供数据支持。
【数据内容】
该数据集基于血浆样本的UPLC-MS/MS非靶向代谢组学分析,共纳入144名参与者。研究采用偏最小二乘判别分析(PLS-DA)三维得分图,用于区分胃癌患者与非胃癌对照。通过代谢 profiling 与差异比较,鉴定出93个胃癌患者与健康对照之间的候选差异血液代谢物。上述内容构成了该数据集的核心数据信息,即参与者规模、分析技术、统计判别方法以及候选差异代谢物数量。除这些信息外,源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。样本类型为血浆样本,分析方式为UPLC-MS/MS非靶向代谢组学。研究共纳入144名参与者,涉及胃癌患者与非胃癌对照的比较。关于样本采集地点、采集时间、机构来源、伦理审批信息、样本处理流程细节等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于胃癌代谢生物标志物相关研究,尤其是基于血浆样本的非靶向代谢组学分析场景。其PLS-DA三维得分图可用于展示胃癌患者与非胃癌对照之间的判别关系;93个候选差异血液代谢物可用于后续标志物筛选、代谢通路分析或验证研究的候选列表。主题标签为代谢组学,因此也适用于代谢组学方法学展示、胃癌与健康对照的代谢差异比较等方向。关于具体临床诊断、预后评估或治疗监测等应用,源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集可通过omicsdi.org获取,具体下载方式、文件格式、数据组织结构和访问权限等,源站未提供。使用时可结合其UPLC-MS/MS非靶向代谢组学数据、144名参与者的分组信息以及PLS-DA判别分析结果,围绕93个候选差异血液代谢物开展进一步分析。关于数据预处理、归一化、缺失值处理、统计阈值和软件参数等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集包含144名参与者,并鉴定出93个候选差异血液代谢物,研究采用PLS-DA三维得分图区分胃癌患者与非胃癌对照。关于样本量是否充分、候选代谢物的验证状态、假阳性控制、批次效应、缺失数据比例、定量准确性及外部验证情况等,源站未提供。因此,使用该数据集时需注意其候选差异代谢物仍属于候选层面,具体可靠性需结合源站未提供的更多质量信息进行判断。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、版权归属及是否允许再分发等信息,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS12684
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
采用UPLC-MS/MS非靶向代谢组学分析血浆样本。数据集包含144名参与者。偏最小二乘判别分析(PLS-DA)三维得分图可区分胃癌患者与非胃癌对照。代谢谱分析和差异比较在胃癌患者与健康对照之间鉴定出93种候选差异血液代谢物。
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