cBioPortal:腺样囊性癌(Sanger/MDA,JCI 2013)
腺样囊性癌是一种相对少见的恶性肿瘤,可发生于唾液腺等部位,具有独特的临床与分子特征,也因此成为肿瘤基因组学研究关注的对象之一

基本信息
资源简介
cBioPortal:腺样囊性癌(Sanger/MDA,JCI 2013)
该数据集为腺样囊性癌(Adenoid Cystic Carcinoma,ACC)的全外显子测序数据集合,由 Sanger 研究所与 MDA 完成,成果发表于 2013 年的 JCI,并以 Adenoid Cystic Carcinoma (Sanger/MDA, JCI 2013) 为标题收录于 cBioPortal 平台。
【数据集背景】
腺样囊性癌是一种相对少见的恶性肿瘤,可发生于唾液腺等部位,具有独特的临床与分子特征,也因此成为肿瘤基因组学研究关注的对象之一。本数据集在 cBioPortal 中以英文名称 cBioPortal: Adenoid Cystic Carcinoma (Sanger/MDA, JCI 2013) 呈现,源站标题为 Adenoid Cystic Carcinoma (Sanger/MDA, JCI 2013),平台分类归入肿瘤 / 其他,并配有主题标签 acyc,便于在平台内检索与归类。数据集所对应的研究工作由 Sanger 研究所与 MDA 共同完成,并于 2013 年发表在 JCI 上。至于该研究的具体科学问题、研究设计思路、样本纳入与排除标准、以及研究结论等信息,源站未提供。
【数据内容】
按照源站的描述,该数据集的核心内容是 Whole exome sequencing of 24 ACCs,即对 24 例腺样囊性癌样本开展全外显子测序。据此可知,其数据类型属于全外显子层面的测序数据,样本规模为 24 例,研究对象为腺样囊性癌。关于具体的突变基因清单、变异类型构成、突变负荷数值、拷贝数信息、临床注释字段、随访数据以及样本的分组情况等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 cbioportal.org,属于 cBioPortal 收录的肿瘤基因组数据集之一。其原始研究工作由 Sanger 研究所与 MDA 开展,发表年份为 2013 年,刊物为 JCI,对应的文献标识为 pmid:23778141。关于样本的采集方式、测序平台与试剂、捕获区间范围、序列比对与变异检出的分析流程、以及数据加工与入库的具体步骤,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于腺样囊性癌相关的基因组学探索,例如在 cBioPortal 平台上浏览该癌种的基因变异情况,或将本数据集与平台上其他肿瘤数据集进行对照参考。对于关注少见肿瘤分子特征的研究者而言,它可作为一项可检索、可浏览的外部数据资源。至于该数据集被推荐用于哪些具体分析任务、是否适合作为某项研究的验证队列,源站未提供相应的说明。
【使用方法】
该数据集托管于 cBioPortal 平台,使用者可通过 cbioportal.org 进行在线浏览与查询,并借助主题标签 acyc 定位到该数据集。关于平台内具体的访问路径、检索入口、可视化模块的操作方式、数据下载的文件格式与途径、以及是否存在接口调用方式等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集覆盖 24 例腺样囊性癌样本,样本量相对有限。除此之外,有关测序深度、覆盖均一性、数据完整性、质控指标、批次效应、数据版本与更新记录等方面的信息,源站未提供。使用者在解读结果时,应留意上述信息的缺失情况,并结合自身研究需求判断是否适用。
【引用与许可】
在引用该数据集或其对应研究时,可参考其来源站 cbioportal.org、数据集标题 Adenoid Cystic Carcinoma (Sanger/MDA, JCI 2013) 以及文献标识 pmid:23778141。关于该数据集的具体许可协议、使用条款、商业用途限制及二次分发规定,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=acyc_sanger_2013
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Whole exome sequencing of 24 ACCs.
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