cBioPortal:腺样囊性癌(MSK,Nat Genet 2013)

该数据集以腺样囊性癌为对象,标题中带有 MSK 与 Nat Genet 2013 信息,说明其与一项标注为 Nat Genet 2013 的研究相关

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基因组分类acyc
cBioPortal: Adenoid Cystic Carcinoma (MSK, Nat Genet 2013)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

cBioPortal:腺样囊性癌(MSK,Nat Genet 2013)

该数据集名为 cBioPortal: Adenoid Cystic Carcinoma (MSK, Nat Genet 2013),来源站点上使用的标题是 Adenoid Cystic Carcinoma (MSK, Nat Genet 2013),内容围绕60对腺样囊性癌肿瘤/正常样本的全外显子或全基因组测序分析展开,来源于 cbioportal.org,标注分类为肿瘤/其他,相关文献标识为 pmid:23685749。

【数据集背景】

该数据集以腺样囊性癌为对象,标题中带有 MSK 与 Nat Genet 2013 信息,说明其与一项标注为 Nat Genet 2013 的研究相关。来源页面对它的简短描述与标题一致,相关标签为 acyc。腺样囊性癌是一种肿瘤类型,因此该资源被归入肿瘤/其他分类。除这些标注外,关于研究发起的完整背景、研究目的、样本纳排标准、伦理审批信息、研究团队构成以及更详细的疾病背景,源站未提供。

【数据内容】

来源页面提供的描述指出,该数据集是对60对 ACC 肿瘤/正常样本进行的全外显子或全基因组测序分析。由此可知,其核心内容涉及60对肿瘤与正常样本配对,并采用全外显子测序或全基因组测序策略。至于每一对样本具体采用全外显子还是全基因组、测序覆盖深度、变异检出结果、突变谱、拷贝数变化、临床注释、样本元数据、文件格式和数据组织方式等,源站未提供。相关主题标签为 acyc,简短描述与标题一致。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org,来源站点上使用的标题为 Adenoid Cystic Carcinoma (MSK, Nat Genet 2013)。来源页面描述其内容为60对 ACC 肿瘤/正常样本的全外显子或全基因组测序分析。相关文献标识为 pmid:23685749,标题中还标注了 MSK 与 Nat Genet 2013。除这些来源信息外,样本采集地点、具体机构、测序平台、建库方法、数据处理流程、采集时间以及数据提交与更新记录,源站未提供。

【适用场景】

从肿瘤基因组数据资源的一般用途看,这类数据可能被用于检索、浏览和研究该腺样囊性癌测序队列,也可能作为肿瘤基因组学教学、方法比较或探索性分析的参考。该数据集标注分类为肿瘤/其他,相关标签为 acyc,名称为 cBioPortal: Adenoid Cystic Carcinoma (MSK, Nat Genet 2013)。不过,该数据集是否适合特定研究问题、是否可用于临床场景、是否有明确批准用途或禁止用途,源站未提供。

【使用方法】

可通过来源站 cbioportal.org 查找该数据集,标题为 Adenoid Cystic Carcinoma (MSK, Nat Genet 2013),相关标签为 acyc,文献标识为 pmid:23685749。访问者可根据来源站点提供的界面进行检索或查看。至于具体检索路径、下载方式、文件格式、是否需要注册登录、是否提供 API、如何筛选样本、如何查看突变或临床信息等操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集涉及60对 ACC 肿瘤/正常样本,测序策略为全外显子或全基因组测序分析,来源为 cbioportal.org,分类为肿瘤/其他,标签为 acyc。关于数据质量评估、测序覆盖度、质控指标、批次效应、样本完整性、数据缺失情况、版本更新、已知偏倚、验证实验以及使用限制,源站未提供。因此,在未获得更多质量信息前,不宜对其完整性和适用边界作额外推断。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考其来源标题 Adenoid Cystic Carcinoma (MSK, Nat Genet 2013) 以及文献标识 pmid:23685749。来源站为 cbioportal.org,分类标注为肿瘤/其他,相关标签为 acyc。关于许可协议、使用条款、再分发条件、商业使用限制、署名要求以及是否允许修改或合并,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=acyc_mskcc_2013

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

60对ACC肿瘤/正常配对样本的全外显子组或全基因组测序分析

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